Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CopaQ8CIE6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CopaQ8CIE6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CopaQ8CIE6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CopaQ8CIE6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CopaQ8CIE6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CopaQ8CIE6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CopaQ8CIE6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CopaQ8CIE6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CopaQ8CIE6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CopaQ8CIE6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CopaQ8CIE6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CopaQ8CIE6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CopaQ8CIE6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CopaQ8CIE6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CopaQ8CIE6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CopaQ8CIE6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CopaQ8CIE6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CopaQ8CIE6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CopaQ8CIE6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CopaQ8CIE6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CopaQ8CIE6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CopaQ8CIE6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CopaQ8CIE6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CopaQ8CIE6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CopaQ8CIE6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CopaQ8CIE6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CopaQ8CIE6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CopaQ8CIE6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CopaQ8CIE6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CopaQ8CIE6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CopaQ8CIE6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CopaQ8CIE6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CopaQ8CIE6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CopaQ8CIE6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CopaQ8CIE6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CopaQ8CIE6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CopaQ8CIE6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CopaQ8CIE6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CopaQ8CIE6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CopaQ8CIE6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CopaQ8CIE6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CopaQ8CIE6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CopaQ8CIE6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CopaQ8CIE6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CopaQ8CIE6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CopaQ8CIE6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CopaQ8CIE6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CopaQ8CIE6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CopaQ8CIE6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CopaQ8CIE6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CopaQ8CIE6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CopaQ8CIE6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CopaQ8CIE6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CopaQ8CIE6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CopaQ8CIE6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CopaQ8CIE6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CopaQ8CIE6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CopaQ8CIE6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CopaQ8CIE6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CopaQ8CIE6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CopaQ8CIE6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CopaQ8CIE6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CopaQ8CIE6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CopaQ8CIE6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CopaQ8CIE6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CopaQ8CIE6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CopaQ8CIE6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CopaQ8CIE6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CopaQ8CIE6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CopaQ8CIE6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CopaQ8CIE6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CopaQ8CIE6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CopaQ8CIE6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CopaQ8CIE6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CopaQ8CIE6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CopaQ8CIE6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CopaQ8CIE6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CopaQ8CIE6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CopaQ8CIE6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CopaQ8CIE6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CopaQ8CIE6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CopaQ8CIE6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CopaQ8CIE6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CopaQ8CIE6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CopaQ8CIE6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CopaQ8CIE6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CopaQ8CIE6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CopaQ8CIE6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CopaQ8CIE6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CopaQ8CIE6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CopaQ8CIE6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CopaQ8CIE6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CopaQ8CIE6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CopaQ8CIE6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CopaQ8CIE6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CopaQ8CIE6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CopaQ8CIE6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CopaQ8CIE6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CopaQ8CIE6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms