Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf17Q8CFA7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf17Q8CFA7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Klf17Q8CFA7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Klf17Q8CFA7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf17Q8CFA7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klf17Q8CFA7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klf17Q8CFA7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf17Q8CFA7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf17Q8CFA7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf17Q8CFA7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf17Q8CFA7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf17Q8CFA7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf17Q8CFA7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf17Q8CFA7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf17Q8CFA7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf17Q8CFA7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf17Q8CFA7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf17Q8CFA7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf17Q8CFA7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf17Q8CFA7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf17Q8CFA7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf17Q8CFA7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf17Q8CFA7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf17Q8CFA7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf17Q8CFA7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf17Q8CFA7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf17Q8CFA7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf17Q8CFA7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf17Q8CFA7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf17Q8CFA7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf17Q8CFA7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf17Q8CFA7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf17Q8CFA7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf17Q8CFA7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf17Q8CFA7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf17Q8CFA7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf17Q8CFA7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Klf17Q8CFA7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf17Q8CFA7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 367.4 ms