Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG3

Vcpip1, Deubiquitinating protein VCIP135, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcpip1Q8CDG3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vcpip1Q8CDG3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vcpip1Q8CDG3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vcpip1Q8CDG3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vcpip1Q8CDG3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vcpip1Q8CDG3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vcpip1Q8CDG3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vcpip1Q8CDG3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vcpip1Q8CDG3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vcpip1Q8CDG3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Vcpip1Q8CDG3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vcpip1Q8CDG3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vcpip1Q8CDG3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vcpip1Q8CDG3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vcpip1Q8CDG3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vcpip1Q8CDG3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vcpip1Q8CDG3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vcpip1Q8CDG3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vcpip1Q8CDG3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vcpip1Q8CDG3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vcpip1Q8CDG3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vcpip1Q8CDG3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vcpip1Q8CDG3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vcpip1Q8CDG3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vcpip1Q8CDG3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vcpip1Q8CDG3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vcpip1Q8CDG3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vcpip1Q8CDG3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vcpip1Q8CDG3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vcpip1Q8CDG3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vcpip1Q8CDG3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vcpip1Q8CDG3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vcpip1Q8CDG3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vcpip1Q8CDG3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vcpip1Q8CDG3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vcpip1Q8CDG3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vcpip1Q8CDG3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vcpip1Q8CDG3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vcpip1Q8CDG3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vcpip1Q8CDG3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vcpip1Q8CDG3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vcpip1Q8CDG3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vcpip1Q8CDG3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vcpip1Q8CDG3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vcpip1Q8CDG3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vcpip1Q8CDG3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vcpip1Q8CDG3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vcpip1Q8CDG3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vcpip1Q8CDG3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vcpip1Q8CDG3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vcpip1Q8CDG3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vcpip1Q8CDG3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Vcpip1Q8CDG3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vcpip1Q8CDG3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vcpip1Q8CDG3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Vcpip1Q8CDG3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vcpip1Q8CDG3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vcpip1Q8CDG3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vcpip1Q8CDG3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Vcpip1Q8CDG3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vcpip1Q8CDG3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vcpip1Q8CDG3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vcpip1Q8CDG3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vcpip1Q8CDG3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vcpip1Q8CDG3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vcpip1Q8CDG3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vcpip1Q8CDG3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vcpip1Q8CDG3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vcpip1Q8CDG3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vcpip1Q8CDG3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vcpip1Q8CDG3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vcpip1Q8CDG3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Vcpip1Q8CDG3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vcpip1Q8CDG3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Vcpip1Q8CDG3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vcpip1Q8CDG3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vcpip1Q8CDG3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vcpip1Q8CDG3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vcpip1Q8CDG3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vcpip1Q8CDG3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vcpip1Q8CDG3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Vcpip1Q8CDG3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vcpip1Q8CDG3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vcpip1Q8CDG3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vcpip1Q8CDG3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vcpip1Q8CDG3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vcpip1Q8CDG3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vcpip1Q8CDG3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vcpip1Q8CDG3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vcpip1Q8CDG3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Vcpip1Q8CDG3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vcpip1Q8CDG3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vcpip1Q8CDG3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vcpip1Q8CDG3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vcpip1Q8CDG3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vcpip1Q8CDG3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vcpip1Q8CDG3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vcpip1Q8CDG3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vcpip1Q8CDG3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vcpip1Q8CDG3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms