Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDE8

Spdye4b, 4933411G11Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdye4bQ8CDE8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spdye4bQ8CDE8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spdye4bQ8CDE8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spdye4bQ8CDE8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spdye4bQ8CDE8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spdye4bQ8CDE8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Spdye4bQ8CDE8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spdye4bQ8CDE8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spdye4bQ8CDE8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spdye4bQ8CDE8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spdye4bQ8CDE8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spdye4bQ8CDE8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Spdye4bQ8CDE8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spdye4bQ8CDE8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spdye4bQ8CDE8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spdye4bQ8CDE8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spdye4bQ8CDE8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spdye4bQ8CDE8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spdye4bQ8CDE8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spdye4bQ8CDE8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spdye4bQ8CDE8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spdye4bQ8CDE8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spdye4bQ8CDE8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spdye4bQ8CDE8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spdye4bQ8CDE8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spdye4bQ8CDE8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spdye4bQ8CDE8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spdye4bQ8CDE8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spdye4bQ8CDE8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spdye4bQ8CDE8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spdye4bQ8CDE8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spdye4bQ8CDE8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spdye4bQ8CDE8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spdye4bQ8CDE8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spdye4bQ8CDE8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spdye4bQ8CDE8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spdye4bQ8CDE8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spdye4bQ8CDE8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spdye4bQ8CDE8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spdye4bQ8CDE8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spdye4bQ8CDE8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spdye4bQ8CDE8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spdye4bQ8CDE8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spdye4bQ8CDE8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spdye4bQ8CDE8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spdye4bQ8CDE8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Spdye4bQ8CDE8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Spdye4bQ8CDE8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Spdye4bQ8CDE8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spdye4bQ8CDE8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spdye4bQ8CDE8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spdye4bQ8CDE8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spdye4bQ8CDE8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spdye4bQ8CDE8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spdye4bQ8CDE8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spdye4bQ8CDE8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spdye4bQ8CDE8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spdye4bQ8CDE8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spdye4bQ8CDE8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spdye4bQ8CDE8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spdye4bQ8CDE8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spdye4bQ8CDE8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spdye4bQ8CDE8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spdye4bQ8CDE8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spdye4bQ8CDE8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spdye4bQ8CDE8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spdye4bQ8CDE8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spdye4bQ8CDE8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spdye4bQ8CDE8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spdye4bQ8CDE8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spdye4bQ8CDE8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spdye4bQ8CDE8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spdye4bQ8CDE8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spdye4bQ8CDE8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spdye4bQ8CDE8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spdye4bQ8CDE8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spdye4bQ8CDE8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spdye4bQ8CDE8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spdye4bQ8CDE8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spdye4bQ8CDE8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spdye4bQ8CDE8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spdye4bQ8CDE8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spdye4bQ8CDE8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spdye4bQ8CDE8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spdye4bQ8CDE8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spdye4bQ8CDE8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spdye4bQ8CDE8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spdye4bQ8CDE8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spdye4bQ8CDE8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spdye4bQ8CDE8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spdye4bQ8CDE8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spdye4bQ8CDE8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spdye4bQ8CDE8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spdye4bQ8CDE8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spdye4bQ8CDE8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spdye4bQ8CDE8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spdye4bQ8CDE8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spdye4bQ8CDE8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spdye4bQ8CDE8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spdye4bQ8CDE8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms