Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCX5

Krt222, Keratin-like protein KRT222, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt222Q8CCX5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt222Q8CCX5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt222Q8CCX5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt222Q8CCX5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt222Q8CCX5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt222Q8CCX5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt222Q8CCX5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt222Q8CCX5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt222Q8CCX5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt222Q8CCX5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt222Q8CCX5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt222Q8CCX5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt222Q8CCX5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt222Q8CCX5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt222Q8CCX5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt222Q8CCX5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt222Q8CCX5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt222Q8CCX5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt222Q8CCX5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt222Q8CCX5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt222Q8CCX5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt222Q8CCX5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt222Q8CCX5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt222Q8CCX5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt222Q8CCX5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt222Q8CCX5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt222Q8CCX5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt222Q8CCX5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt222Q8CCX5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt222Q8CCX5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt222Q8CCX5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt222Q8CCX5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt222Q8CCX5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt222Q8CCX5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt222Q8CCX5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt222Q8CCX5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt222Q8CCX5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt222Q8CCX5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt222Q8CCX5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt222Q8CCX5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt222Q8CCX5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt222Q8CCX5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt222Q8CCX5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt222Q8CCX5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt222Q8CCX5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt222Q8CCX5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt222Q8CCX5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt222Q8CCX5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt222Q8CCX5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt222Q8CCX5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt222Q8CCX5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt222Q8CCX5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt222Q8CCX5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Krt222Q8CCX5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Krt222Q8CCX5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt222Q8CCX5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt222Q8CCX5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt222Q8CCX5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt222Q8CCX5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt222Q8CCX5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt222Q8CCX5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt222Q8CCX5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt222Q8CCX5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt222Q8CCX5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt222Q8CCX5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt222Q8CCX5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt222Q8CCX5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt222Q8CCX5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt222Q8CCX5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt222Q8CCX5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt222Q8CCX5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt222Q8CCX5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt222Q8CCX5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt222Q8CCX5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt222Q8CCX5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt222Q8CCX5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt222Q8CCX5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt222Q8CCX5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt222Q8CCX5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt222Q8CCX5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt222Q8CCX5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt222Q8CCX5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt222Q8CCX5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt222Q8CCX5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt222Q8CCX5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt222Q8CCX5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt222Q8CCX5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt222Q8CCX5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt222Q8CCX5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt222Q8CCX5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt222Q8CCX5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt222Q8CCX5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt222Q8CCX5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt222Q8CCX5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt222Q8CCX5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt222Q8CCX5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt222Q8CCX5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt222Q8CCX5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt222Q8CCX5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt222Q8CCX5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms