Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ufl1Q8CCJ3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ufl1Q8CCJ3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ufl1Q8CCJ3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ufl1Q8CCJ3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ufl1Q8CCJ3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ufl1Q8CCJ3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ufl1Q8CCJ3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ufl1Q8CCJ3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ufl1Q8CCJ3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ufl1Q8CCJ3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ufl1Q8CCJ3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ufl1Q8CCJ3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ufl1Q8CCJ3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ufl1Q8CCJ3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ufl1Q8CCJ3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ufl1Q8CCJ3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ufl1Q8CCJ3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ufl1Q8CCJ3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ufl1Q8CCJ3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ufl1Q8CCJ3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ufl1Q8CCJ3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ufl1Q8CCJ3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ufl1Q8CCJ3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ufl1Q8CCJ3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ufl1Q8CCJ3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ufl1Q8CCJ3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ufl1Q8CCJ3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ufl1Q8CCJ3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ufl1Q8CCJ3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ufl1Q8CCJ3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ufl1Q8CCJ3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ufl1Q8CCJ3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ufl1Q8CCJ3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ufl1Q8CCJ3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ufl1Q8CCJ3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ufl1Q8CCJ3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ufl1Q8CCJ3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ufl1Q8CCJ3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ufl1Q8CCJ3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ufl1Q8CCJ3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ufl1Q8CCJ3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ufl1Q8CCJ3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ufl1Q8CCJ3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ufl1Q8CCJ3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ufl1Q8CCJ3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ufl1Q8CCJ3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ufl1Q8CCJ3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ufl1Q8CCJ3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ufl1Q8CCJ3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ufl1Q8CCJ3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ufl1Q8CCJ3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ufl1Q8CCJ3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ufl1Q8CCJ3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ufl1Q8CCJ3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ufl1Q8CCJ3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ufl1Q8CCJ3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ufl1Q8CCJ3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ufl1Q8CCJ3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ufl1Q8CCJ3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ufl1Q8CCJ3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ufl1Q8CCJ3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ufl1Q8CCJ3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ufl1Q8CCJ3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ufl1Q8CCJ3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ufl1Q8CCJ3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ufl1Q8CCJ3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ufl1Q8CCJ3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ufl1Q8CCJ3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ufl1Q8CCJ3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ufl1Q8CCJ3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ufl1Q8CCJ3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Ufl1Q8CCJ3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ufl1Q8CCJ3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ufl1Q8CCJ3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ufl1Q8CCJ3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ufl1Q8CCJ3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ufl1Q8CCJ3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ufl1Q8CCJ3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ufl1Q8CCJ3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ufl1Q8CCJ3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ufl1Q8CCJ3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ufl1Q8CCJ3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ufl1Q8CCJ3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ufl1Q8CCJ3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ufl1Q8CCJ3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ufl1Q8CCJ3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ufl1Q8CCJ3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ufl1Q8CCJ3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ufl1Q8CCJ3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ufl1Q8CCJ3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ufl1Q8CCJ3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ufl1Q8CCJ3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ufl1Q8CCJ3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ufl1Q8CCJ3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ufl1Q8CCJ3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ufl1Q8CCJ3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ufl1Q8CCJ3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ufl1Q8CCJ3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ufl1Q8CCJ3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms