Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
E4f1Q8CCE9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
E4f1Q8CCE9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
E4f1Q8CCE9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
E4f1Q8CCE9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
E4f1Q8CCE9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
E4f1Q8CCE9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
E4f1Q8CCE9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
E4f1Q8CCE9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
E4f1Q8CCE9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
E4f1Q8CCE9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
E4f1Q8CCE9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
E4f1Q8CCE9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
E4f1Q8CCE9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
E4f1Q8CCE9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
E4f1Q8CCE9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
E4f1Q8CCE9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
E4f1Q8CCE9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
E4f1Q8CCE9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
E4f1Q8CCE9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
E4f1Q8CCE9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
E4f1Q8CCE9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
E4f1Q8CCE9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
E4f1Q8CCE9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
E4f1Q8CCE9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
E4f1Q8CCE9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
E4f1Q8CCE9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
E4f1Q8CCE9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
E4f1Q8CCE9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
E4f1Q8CCE9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
E4f1Q8CCE9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
E4f1Q8CCE9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
E4f1Q8CCE9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
E4f1Q8CCE9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
E4f1Q8CCE9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
E4f1Q8CCE9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
E4f1Q8CCE9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
E4f1Q8CCE9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
E4f1Q8CCE9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
E4f1Q8CCE9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
E4f1Q8CCE9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
E4f1Q8CCE9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
E4f1Q8CCE9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
E4f1Q8CCE9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
E4f1Q8CCE9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
E4f1Q8CCE9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
E4f1Q8CCE9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
E4f1Q8CCE9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
E4f1Q8CCE9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
E4f1Q8CCE9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
E4f1Q8CCE9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
E4f1Q8CCE9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
E4f1Q8CCE9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
E4f1Q8CCE9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
E4f1Q8CCE9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
E4f1Q8CCE9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
E4f1Q8CCE9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
E4f1Q8CCE9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
E4f1Q8CCE9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
E4f1Q8CCE9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
E4f1Q8CCE9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
E4f1Q8CCE9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
E4f1Q8CCE9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
E4f1Q8CCE9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
E4f1Q8CCE9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
E4f1Q8CCE9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
E4f1Q8CCE9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
E4f1Q8CCE9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
E4f1Q8CCE9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
E4f1Q8CCE9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
E4f1Q8CCE9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
E4f1Q8CCE9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
E4f1Q8CCE9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
E4f1Q8CCE9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
E4f1Q8CCE9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
E4f1Q8CCE9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
E4f1Q8CCE9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
E4f1Q8CCE9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
E4f1Q8CCE9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
E4f1Q8CCE9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
E4f1Q8CCE9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
E4f1Q8CCE9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
E4f1Q8CCE9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
E4f1Q8CCE9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
E4f1Q8CCE9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
E4f1Q8CCE9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
E4f1Q8CCE9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
E4f1Q8CCE9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
E4f1Q8CCE9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
E4f1Q8CCE9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
E4f1Q8CCE9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
E4f1Q8CCE9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
E4f1Q8CCE9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
E4f1Q8CCE9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
E4f1Q8CCE9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
E4f1Q8CCE9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
E4f1Q8CCE9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
E4f1Q8CCE9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
E4f1Q8CCE9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
E4f1Q8CCE9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 220 ms