Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slfn5Q8CBA2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slfn5Q8CBA2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slfn5Q8CBA2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slfn5Q8CBA2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slfn5Q8CBA2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slfn5Q8CBA2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slfn5Q8CBA2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slfn5Q8CBA2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slfn5Q8CBA2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slfn5Q8CBA2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slfn5Q8CBA2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slfn5Q8CBA2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slfn5Q8CBA2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slfn5Q8CBA2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slfn5Q8CBA2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slfn5Q8CBA2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slfn5Q8CBA2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slfn5Q8CBA2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slfn5Q8CBA2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slfn5Q8CBA2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Slfn5Q8CBA2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slfn5Q8CBA2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slfn5Q8CBA2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slfn5Q8CBA2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slfn5Q8CBA2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slfn5Q8CBA2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slfn5Q8CBA2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slfn5Q8CBA2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slfn5Q8CBA2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slfn5Q8CBA2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slfn5Q8CBA2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slfn5Q8CBA2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slfn5Q8CBA2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slfn5Q8CBA2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slfn5Q8CBA2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slfn5Q8CBA2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slfn5Q8CBA2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slfn5Q8CBA2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slfn5Q8CBA2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slfn5Q8CBA2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slfn5Q8CBA2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slfn5Q8CBA2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slfn5Q8CBA2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slfn5Q8CBA2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slfn5Q8CBA2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slfn5Q8CBA2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slfn5Q8CBA2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slfn5Q8CBA2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slfn5Q8CBA2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slfn5Q8CBA2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slfn5Q8CBA2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slfn5Q8CBA2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Slfn5Q8CBA2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slfn5Q8CBA2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slfn5Q8CBA2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slfn5Q8CBA2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slfn5Q8CBA2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slfn5Q8CBA2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slfn5Q8CBA2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Slfn5Q8CBA2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slfn5Q8CBA2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slfn5Q8CBA2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slfn5Q8CBA2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Slfn5Q8CBA2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slfn5Q8CBA2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slfn5Q8CBA2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slfn5Q8CBA2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Slfn5Q8CBA2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slfn5Q8CBA2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slfn5Q8CBA2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slfn5Q8CBA2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slfn5Q8CBA2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slfn5Q8CBA2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slfn5Q8CBA2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms