Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAL5

Gpc5, Glypican-5, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc5Q8CAL5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gpc5Q8CAL5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gpc5Q8CAL5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gpc5Q8CAL5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gpc5Q8CAL5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gpc5Q8CAL5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gpc5Q8CAL5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gpc5Q8CAL5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gpc5Q8CAL5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gpc5Q8CAL5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gpc5Q8CAL5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gpc5Q8CAL5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gpc5Q8CAL5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gpc5Q8CAL5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpc5Q8CAL5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpc5Q8CAL5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpc5Q8CAL5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpc5Q8CAL5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpc5Q8CAL5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpc5Q8CAL5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpc5Q8CAL5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpc5Q8CAL5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpc5Q8CAL5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpc5Q8CAL5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpc5Q8CAL5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpc5Q8CAL5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpc5Q8CAL5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpc5Q8CAL5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpc5Q8CAL5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gpc5Q8CAL5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gpc5Q8CAL5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gpc5Q8CAL5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gpc5Q8CAL5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gpc5Q8CAL5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gpc5Q8CAL5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gpc5Q8CAL5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gpc5Q8CAL5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gpc5Q8CAL5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gpc5Q8CAL5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gpc5Q8CAL5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gpc5Q8CAL5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gpc5Q8CAL5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gpc5Q8CAL5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gpc5Q8CAL5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gpc5Q8CAL5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gpc5Q8CAL5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gpc5Q8CAL5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gpc5Q8CAL5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gpc5Q8CAL5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gpc5Q8CAL5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gpc5Q8CAL5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gpc5Q8CAL5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gpc5Q8CAL5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gpc5Q8CAL5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gpc5Q8CAL5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gpc5Q8CAL5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms