Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9L1

BC106179, BC106179 protein, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC106179Q8C9L1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC106179Q8C9L1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC106179Q8C9L1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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BC106179Q8C9L1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC106179Q8C9L1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC106179Q8C9L1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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BC106179Q8C9L1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC106179Q8C9L1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC106179Q8C9L1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC106179Q8C9L1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC106179Q8C9L1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC106179Q8C9L1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC106179Q8C9L1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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BC106179Q8C9L1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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BC106179Q8C9L1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC106179Q8C9L1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC106179Q8C9L1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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BC106179Q8C9L1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC106179Q8C9L1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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BC106179Q8C9L1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC106179Q8C9L1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC106179Q8C9L1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC106179Q8C9L1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC106179Q8C9L1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC106179Q8C9L1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BC106179Q8C9L1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC106179Q8C9L1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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BC106179Q8C9L1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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BC106179Q8C9L1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC106179Q8C9L1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC106179Q8C9L1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC106179Q8C9L1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC106179Q8C9L1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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BC106179Q8C9L1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC106179Q8C9L1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC106179Q8C9L1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC106179Q8C9L1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC106179Q8C9L1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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BC106179Q8C9L1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC106179Q8C9L1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC106179Q8C9L1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC106179Q8C9L1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC106179Q8C9L1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC106179Q8C9L1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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BC106179Q8C9L1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC106179Q8C9L1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC106179Q8C9L1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC106179Q8C9L1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC106179Q8C9L1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC106179Q8C9L1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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BC106179Q8C9L1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC106179Q8C9L1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC106179Q8C9L1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC106179Q8C9L1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC106179Q8C9L1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC106179Q8C9L1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC106179Q8C9L1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC106179Q8C9L1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC106179Q8C9L1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BC106179Q8C9L1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC106179Q8C9L1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC106179Q8C9L1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC106179Q8C9L1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC106179Q8C9L1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC106179Q8C9L1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC106179Q8C9L1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC106179Q8C9L1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC106179Q8C9L1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC106179Q8C9L1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC106179Q8C9L1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC106179Q8C9L1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC106179Q8C9L1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC106179Q8C9L1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC106179Q8C9L1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BC106179Q8C9L1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC106179Q8C9L1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC106179Q8C9L1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC106179Q8C9L1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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BC106179Q8C9L1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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