Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7M3

Trim9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, mousemouse

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim9Q8C7M3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim9Q8C7M3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim9Q8C7M3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim9Q8C7M3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim9Q8C7M3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim9Q8C7M3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim9Q8C7M3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim9Q8C7M3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim9Q8C7M3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim9Q8C7M3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim9Q8C7M3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim9Q8C7M3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim9Q8C7M3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim9Q8C7M3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim9Q8C7M3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim9Q8C7M3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim9Q8C7M3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim9Q8C7M3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim9Q8C7M3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim9Q8C7M3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim9Q8C7M3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim9Q8C7M3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim9Q8C7M3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim9Q8C7M3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim9Q8C7M3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim9Q8C7M3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim9Q8C7M3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim9Q8C7M3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim9Q8C7M3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim9Q8C7M3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim9Q8C7M3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim9Q8C7M3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim9Q8C7M3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim9Q8C7M3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim9Q8C7M3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim9Q8C7M3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim9Q8C7M3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim9Q8C7M3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim9Q8C7M3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim9Q8C7M3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim9Q8C7M3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim9Q8C7M3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim9Q8C7M3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim9Q8C7M3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim9Q8C7M3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim9Q8C7M3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim9Q8C7M3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim9Q8C7M3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim9Q8C7M3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim9Q8C7M3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim9Q8C7M3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim9Q8C7M3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim9Q8C7M3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms