Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp20Q8C6M1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp20Q8C6M1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp20Q8C6M1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp20Q8C6M1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp20Q8C6M1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp20Q8C6M1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp20Q8C6M1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp20Q8C6M1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp20Q8C6M1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp20Q8C6M1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp20Q8C6M1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp20Q8C6M1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp20Q8C6M1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp20Q8C6M1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp20Q8C6M1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp20Q8C6M1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp20Q8C6M1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp20Q8C6M1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp20Q8C6M1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp20Q8C6M1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp20Q8C6M1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp20Q8C6M1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp20Q8C6M1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp20Q8C6M1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp20Q8C6M1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp20Q8C6M1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp20Q8C6M1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp20Q8C6M1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp20Q8C6M1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp20Q8C6M1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp20Q8C6M1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp20Q8C6M1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp20Q8C6M1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp20Q8C6M1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp20Q8C6M1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp20Q8C6M1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp20Q8C6M1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp20Q8C6M1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp20Q8C6M1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp20Q8C6M1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp20Q8C6M1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp20Q8C6M1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp20Q8C6M1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp20Q8C6M1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp20Q8C6M1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp20Q8C6M1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp20Q8C6M1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp20Q8C6M1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp20Q8C6M1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp20Q8C6M1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp20Q8C6M1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp20Q8C6M1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp20Q8C6M1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp20Q8C6M1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
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