Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6B2

Rtkn, Rhotekin, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtknQ8C6B2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RtknQ8C6B2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RtknQ8C6B2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RtknQ8C6B2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RtknQ8C6B2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RtknQ8C6B2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RtknQ8C6B2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RtknQ8C6B2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RtknQ8C6B2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RtknQ8C6B2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RtknQ8C6B2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RtknQ8C6B2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RtknQ8C6B2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RtknQ8C6B2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RtknQ8C6B2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RtknQ8C6B2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RtknQ8C6B2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RtknQ8C6B2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RtknQ8C6B2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RtknQ8C6B2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RtknQ8C6B2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RtknQ8C6B2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RtknQ8C6B2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RtknQ8C6B2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RtknQ8C6B2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RtknQ8C6B2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RtknQ8C6B2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RtknQ8C6B2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RtknQ8C6B2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RtknQ8C6B2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RtknQ8C6B2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RtknQ8C6B2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RtknQ8C6B2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RtknQ8C6B2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RtknQ8C6B2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RtknQ8C6B2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RtknQ8C6B2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RtknQ8C6B2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RtknQ8C6B2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RtknQ8C6B2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RtknQ8C6B2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RtknQ8C6B2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RtknQ8C6B2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RtknQ8C6B2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RtknQ8C6B2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RtknQ8C6B2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RtknQ8C6B2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RtknQ8C6B2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RtknQ8C6B2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RtknQ8C6B2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RtknQ8C6B2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RtknQ8C6B2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RtknQ8C6B2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RtknQ8C6B2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RtknQ8C6B2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RtknQ8C6B2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RtknQ8C6B2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RtknQ8C6B2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RtknQ8C6B2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RtknQ8C6B2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RtknQ8C6B2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RtknQ8C6B2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RtknQ8C6B2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RtknQ8C6B2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RtknQ8C6B2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RtknQ8C6B2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RtknQ8C6B2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RtknQ8C6B2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RtknQ8C6B2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RtknQ8C6B2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RtknQ8C6B2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RtknQ8C6B2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RtknQ8C6B2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RtknQ8C6B2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RtknQ8C6B2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RtknQ8C6B2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RtknQ8C6B2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RtknQ8C6B2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RtknQ8C6B2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RtknQ8C6B2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RtknQ8C6B2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RtknQ8C6B2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RtknQ8C6B2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RtknQ8C6B2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RtknQ8C6B2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RtknQ8C6B2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RtknQ8C6B2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RtknQ8C6B2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RtknQ8C6B2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RtknQ8C6B2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RtknQ8C6B2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RtknQ8C6B2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RtknQ8C6B2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RtknQ8C6B2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RtknQ8C6B2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RtknQ8C6B2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RtknQ8C6B2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RtknQ8C6B2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RtknQ8C6B2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RtknQ8C6B2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms