Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc113Q8C5T8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc113Q8C5T8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc113Q8C5T8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc113Q8C5T8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc113Q8C5T8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc113Q8C5T8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc113Q8C5T8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc113Q8C5T8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc113Q8C5T8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc113Q8C5T8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc113Q8C5T8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc113Q8C5T8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc113Q8C5T8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc113Q8C5T8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc113Q8C5T8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc113Q8C5T8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc113Q8C5T8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc113Q8C5T8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc113Q8C5T8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc113Q8C5T8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc113Q8C5T8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc113Q8C5T8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc113Q8C5T8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc113Q8C5T8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc113Q8C5T8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc113Q8C5T8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc113Q8C5T8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc113Q8C5T8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc113Q8C5T8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc113Q8C5T8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc113Q8C5T8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc113Q8C5T8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc113Q8C5T8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc113Q8C5T8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc113Q8C5T8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc113Q8C5T8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc113Q8C5T8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc113Q8C5T8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc113Q8C5T8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc113Q8C5T8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc113Q8C5T8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc113Q8C5T8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc113Q8C5T8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc113Q8C5T8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc113Q8C5T8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc113Q8C5T8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc113Q8C5T8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc113Q8C5T8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc113Q8C5T8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc113Q8C5T8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc113Q8C5T8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc113Q8C5T8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc113Q8C5T8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc113Q8C5T8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc113Q8C5T8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc113Q8C5T8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc113Q8C5T8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc113Q8C5T8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc113Q8C5T8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc113Q8C5T8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc113Q8C5T8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc113Q8C5T8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc113Q8C5T8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc113Q8C5T8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc113Q8C5T8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc113Q8C5T8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc113Q8C5T8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc113Q8C5T8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc113Q8C5T8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc113Q8C5T8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc113Q8C5T8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc113Q8C5T8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc113Q8C5T8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc113Q8C5T8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc113Q8C5T8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc113Q8C5T8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc113Q8C5T8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc113Q8C5T8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc113Q8C5T8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc113Q8C5T8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc113Q8C5T8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc113Q8C5T8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc113Q8C5T8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc113Q8C5T8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc113Q8C5T8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc113Q8C5T8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc113Q8C5T8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc113Q8C5T8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc113Q8C5T8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc113Q8C5T8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc113Q8C5T8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc113Q8C5T8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc113Q8C5T8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc113Q8C5T8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc113Q8C5T8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc113Q8C5T8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc113Q8C5T8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc113Q8C5T8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms