Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac7Q8C2B3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac7Q8C2B3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac7Q8C2B3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac7Q8C2B3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac7Q8C2B3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac7Q8C2B3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac7Q8C2B3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac7Q8C2B3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac7Q8C2B3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac7Q8C2B3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac7Q8C2B3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac7Q8C2B3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac7Q8C2B3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac7Q8C2B3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac7Q8C2B3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac7Q8C2B3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac7Q8C2B3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac7Q8C2B3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac7Q8C2B3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac7Q8C2B3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac7Q8C2B3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac7Q8C2B3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac7Q8C2B3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac7Q8C2B3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac7Q8C2B3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac7Q8C2B3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac7Q8C2B3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac7Q8C2B3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac7Q8C2B3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac7Q8C2B3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac7Q8C2B3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac7Q8C2B3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac7Q8C2B3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac7Q8C2B3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac7Q8C2B3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac7Q8C2B3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hdac7Q8C2B3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac7Q8C2B3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Hdac7Q8C2B3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hdac7Q8C2B3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac7Q8C2B3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac7Q8C2B3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac7Q8C2B3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac7Q8C2B3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac7Q8C2B3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac7Q8C2B3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac7Q8C2B3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac7Q8C2B3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac7Q8C2B3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac7Q8C2B3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac7Q8C2B3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac7Q8C2B3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac7Q8C2B3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms