Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1F4

Csgalnact2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csgalnact2Q8C1F4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Csgalnact2Q8C1F4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Csgalnact2Q8C1F4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Csgalnact2Q8C1F4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Csgalnact2Q8C1F4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Csgalnact2Q8C1F4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Csgalnact2Q8C1F4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Csgalnact2Q8C1F4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Csgalnact2Q8C1F4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Csgalnact2Q8C1F4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Csgalnact2Q8C1F4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Csgalnact2Q8C1F4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Csgalnact2Q8C1F4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Csgalnact2Q8C1F4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Csgalnact2Q8C1F4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Csgalnact2Q8C1F4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Csgalnact2Q8C1F4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Csgalnact2Q8C1F4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Csgalnact2Q8C1F4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Csgalnact2Q8C1F4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Csgalnact2Q8C1F4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Csgalnact2Q8C1F4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Csgalnact2Q8C1F4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Csgalnact2Q8C1F4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Csgalnact2Q8C1F4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Csgalnact2Q8C1F4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Csgalnact2Q8C1F4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Csgalnact2Q8C1F4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Csgalnact2Q8C1F4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Csgalnact2Q8C1F4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Csgalnact2Q8C1F4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Csgalnact2Q8C1F4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Csgalnact2Q8C1F4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Csgalnact2Q8C1F4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Csgalnact2Q8C1F4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Csgalnact2Q8C1F4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Csgalnact2Q8C1F4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Csgalnact2Q8C1F4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Csgalnact2Q8C1F4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Csgalnact2Q8C1F4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Csgalnact2Q8C1F4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Csgalnact2Q8C1F4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Csgalnact2Q8C1F4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Csgalnact2Q8C1F4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Csgalnact2Q8C1F4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Csgalnact2Q8C1F4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Csgalnact2Q8C1F4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Csgalnact2Q8C1F4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Csgalnact2Q8C1F4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Csgalnact2Q8C1F4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Csgalnact2Q8C1F4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Csgalnact2Q8C1F4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Csgalnact2Q8C1F4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Csgalnact2Q8C1F4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Csgalnact2Q8C1F4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Csgalnact2Q8C1F4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Csgalnact2Q8C1F4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Csgalnact2Q8C1F4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Csgalnact2Q8C1F4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Csgalnact2Q8C1F4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms