Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYI9

Tnr, Tenascin-R, mousemouse

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnrQ8BYI9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TnrQ8BYI9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TnrQ8BYI9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TnrQ8BYI9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TnrQ8BYI9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TnrQ8BYI9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TnrQ8BYI9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TnrQ8BYI9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TnrQ8BYI9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TnrQ8BYI9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TnrQ8BYI9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TnrQ8BYI9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TnrQ8BYI9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TnrQ8BYI9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TnrQ8BYI9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TnrQ8BYI9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TnrQ8BYI9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TnrQ8BYI9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TnrQ8BYI9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TnrQ8BYI9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TnrQ8BYI9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TnrQ8BYI9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TnrQ8BYI9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TnrQ8BYI9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TnrQ8BYI9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TnrQ8BYI9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TnrQ8BYI9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TnrQ8BYI9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TnrQ8BYI9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TnrQ8BYI9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TnrQ8BYI9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TnrQ8BYI9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TnrQ8BYI9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TnrQ8BYI9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TnrQ8BYI9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TnrQ8BYI9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TnrQ8BYI9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TnrQ8BYI9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TnrQ8BYI9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TnrQ8BYI9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TnrQ8BYI9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TnrQ8BYI9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TnrQ8BYI9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TnrQ8BYI9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TnrQ8BYI9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TnrQ8BYI9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TnrQ8BYI9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TnrQ8BYI9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TnrQ8BYI9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TnrQ8BYI9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TnrQ8BYI9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TnrQ8BYI9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TnrQ8BYI9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TnrQ8BYI9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TnrQ8BYI9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TnrQ8BYI9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TnrQ8BYI9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
TnrQ8BYI9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TnrQ8BYI9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TnrQ8BYI9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TnrQ8BYI9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TnrQ8BYI9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TnrQ8BYI9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TnrQ8BYI9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TnrQ8BYI9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TnrQ8BYI9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TnrQ8BYI9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TnrQ8BYI9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TnrQ8BYI9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TnrQ8BYI9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TnrQ8BYI9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TnrQ8BYI9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TnrQ8BYI9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TnrQ8BYI9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TnrQ8BYI9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TnrQ8BYI9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TnrQ8BYI9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TnrQ8BYI9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TnrQ8BYI9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TnrQ8BYI9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TnrQ8BYI9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TnrQ8BYI9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TnrQ8BYI9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TnrQ8BYI9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TnrQ8BYI9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TnrQ8BYI9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TnrQ8BYI9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TnrQ8BYI9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TnrQ8BYI9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
TnrQ8BYI9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
TnrQ8BYI9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TnrQ8BYI9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TnrQ8BYI9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TnrQ8BYI9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TnrQ8BYI9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TnrQ8BYI9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TnrQ8BYI9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TnrQ8BYI9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TnrQ8BYI9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TnrQ8BYI9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms