Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rbbp5Q8BX09 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp5Q8BX09 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp5Q8BX09 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp5Q8BX09 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp5Q8BX09 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp5Q8BX09 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp5Q8BX09 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp5Q8BX09 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp5Q8BX09 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp5Q8BX09 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp5Q8BX09 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp5Q8BX09 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp5Q8BX09 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp5Q8BX09 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp5Q8BX09 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbbp5Q8BX09 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbbp5Q8BX09 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbbp5Q8BX09 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbbp5Q8BX09 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbbp5Q8BX09 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbbp5Q8BX09 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbbp5Q8BX09 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbbp5Q8BX09 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbbp5Q8BX09 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbbp5Q8BX09 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbbp5Q8BX09 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbbp5Q8BX09 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbbp5Q8BX09 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbbp5Q8BX09 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbbp5Q8BX09 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbbp5Q8BX09 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbbp5Q8BX09 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbbp5Q8BX09 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbbp5Q8BX09 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbbp5Q8BX09 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbbp5Q8BX09 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbbp5Q8BX09 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbbp5Q8BX09 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbbp5Q8BX09 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbbp5Q8BX09 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbbp5Q8BX09 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbbp5Q8BX09 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rbbp5Q8BX09 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rbbp5Q8BX09 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rbbp5Q8BX09 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbbp5Q8BX09 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbbp5Q8BX09 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbbp5Q8BX09 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms