Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctdsp2Q8BX07 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctdsp2Q8BX07 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctdsp2Q8BX07 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctdsp2Q8BX07 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctdsp2Q8BX07 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctdsp2Q8BX07 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctdsp2Q8BX07 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctdsp2Q8BX07 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctdsp2Q8BX07 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctdsp2Q8BX07 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctdsp2Q8BX07 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctdsp2Q8BX07 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctdsp2Q8BX07 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctdsp2Q8BX07 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctdsp2Q8BX07 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctdsp2Q8BX07 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ctdsp2Q8BX07 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Ctdsp2Q8BX07 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ctdsp2Q8BX07 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctdsp2Q8BX07 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctdsp2Q8BX07 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctdsp2Q8BX07 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctdsp2Q8BX07 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctdsp2Q8BX07 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ctdsp2Q8BX07 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ctdsp2Q8BX07 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctdsp2Q8BX07 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ctdsp2Q8BX07 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ctdsp2Q8BX07 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ctdsp2Q8BX07 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ctdsp2Q8BX07 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctdsp2Q8BX07 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctdsp2Q8BX07 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctdsp2Q8BX07 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctdsp2Q8BX07 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctdsp2Q8BX07 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctdsp2Q8BX07 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctdsp2Q8BX07 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctdsp2Q8BX07 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctdsp2Q8BX07 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctdsp2Q8BX07 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctdsp2Q8BX07 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctdsp2Q8BX07 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdsp2Q8BX07 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdsp2Q8BX07 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdsp2Q8BX07 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdsp2Q8BX07 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdsp2Q8BX07 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdsp2Q8BX07 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctdsp2Q8BX07 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctdsp2Q8BX07 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctdsp2Q8BX07 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctdsp2Q8BX07 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctdsp2Q8BX07 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctdsp2Q8BX07 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctdsp2Q8BX07 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Ctdsp2Q8BX07 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctdsp2Q8BX07 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Ctdsp2Q8BX07 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctdsp2Q8BX07 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Ctdsp2Q8BX07 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Ctdsp2Q8BX07 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctdsp2Q8BX07 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctdsp2Q8BX07 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctdsp2Q8BX07 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctdsp2Q8BX07 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctdsp2Q8BX07 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctdsp2Q8BX07 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctdsp2Q8BX07 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctdsp2Q8BX07 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctdsp2Q8BX07 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctdsp2Q8BX07 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctdsp2Q8BX07 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctdsp2Q8BX07 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctdsp2Q8BX07 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctdsp2Q8BX07 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctdsp2Q8BX07 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ctdsp2Q8BX07 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ctdsp2Q8BX07 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ctdsp2Q8BX07 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ctdsp2Q8BX07 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ctdsp2Q8BX07 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ctdsp2Q8BX07 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctdsp2Q8BX07 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctdsp2Q8BX07 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctdsp2Q8BX07 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctdsp2Q8BX07 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctdsp2Q8BX07 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctdsp2Q8BX07 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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