Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TtpaQ8BWP5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TtpaQ8BWP5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TtpaQ8BWP5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TtpaQ8BWP5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TtpaQ8BWP5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TtpaQ8BWP5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TtpaQ8BWP5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TtpaQ8BWP5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TtpaQ8BWP5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TtpaQ8BWP5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TtpaQ8BWP5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TtpaQ8BWP5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TtpaQ8BWP5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TtpaQ8BWP5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TtpaQ8BWP5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TtpaQ8BWP5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TtpaQ8BWP5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TtpaQ8BWP5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TtpaQ8BWP5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TtpaQ8BWP5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TtpaQ8BWP5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TtpaQ8BWP5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TtpaQ8BWP5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TtpaQ8BWP5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TtpaQ8BWP5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TtpaQ8BWP5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TtpaQ8BWP5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TtpaQ8BWP5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TtpaQ8BWP5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TtpaQ8BWP5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TtpaQ8BWP5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TtpaQ8BWP5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TtpaQ8BWP5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TtpaQ8BWP5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TtpaQ8BWP5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TtpaQ8BWP5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TtpaQ8BWP5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TtpaQ8BWP5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TtpaQ8BWP5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TtpaQ8BWP5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TtpaQ8BWP5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TtpaQ8BWP5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TtpaQ8BWP5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TtpaQ8BWP5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TtpaQ8BWP5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TtpaQ8BWP5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TtpaQ8BWP5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TtpaQ8BWP5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TtpaQ8BWP5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TtpaQ8BWP5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TtpaQ8BWP5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TtpaQ8BWP5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TtpaQ8BWP5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TtpaQ8BWP5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TtpaQ8BWP5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms