Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU7

Rccd1, RCC1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rccd1Q8BTU7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rccd1Q8BTU7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rccd1Q8BTU7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rccd1Q8BTU7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rccd1Q8BTU7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rccd1Q8BTU7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rccd1Q8BTU7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rccd1Q8BTU7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rccd1Q8BTU7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rccd1Q8BTU7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rccd1Q8BTU7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rccd1Q8BTU7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rccd1Q8BTU7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rccd1Q8BTU7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rccd1Q8BTU7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rccd1Q8BTU7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rccd1Q8BTU7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rccd1Q8BTU7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rccd1Q8BTU7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rccd1Q8BTU7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rccd1Q8BTU7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rccd1Q8BTU7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rccd1Q8BTU7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rccd1Q8BTU7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rccd1Q8BTU7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rccd1Q8BTU7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rccd1Q8BTU7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rccd1Q8BTU7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rccd1Q8BTU7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rccd1Q8BTU7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rccd1Q8BTU7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rccd1Q8BTU7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rccd1Q8BTU7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Rccd1Q8BTU7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rccd1Q8BTU7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rccd1Q8BTU7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rccd1Q8BTU7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rccd1Q8BTU7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rccd1Q8BTU7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rccd1Q8BTU7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rccd1Q8BTU7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rccd1Q8BTU7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rccd1Q8BTU7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rccd1Q8BTU7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rccd1Q8BTU7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rccd1Q8BTU7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rccd1Q8BTU7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rccd1Q8BTU7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rccd1Q8BTU7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rccd1Q8BTU7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rccd1Q8BTU7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rccd1Q8BTU7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rccd1Q8BTU7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rccd1Q8BTU7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rccd1Q8BTU7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rccd1Q8BTU7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rccd1Q8BTU7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rccd1Q8BTU7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rccd1Q8BTU7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rccd1Q8BTU7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rccd1Q8BTU7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rccd1Q8BTU7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rccd1Q8BTU7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rccd1Q8BTU7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rccd1Q8BTU7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rccd1Q8BTU7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rccd1Q8BTU7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rccd1Q8BTU7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rccd1Q8BTU7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rccd1Q8BTU7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rccd1Q8BTU7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rccd1Q8BTU7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rccd1Q8BTU7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rccd1Q8BTU7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rccd1Q8BTU7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rccd1Q8BTU7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rccd1Q8BTU7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rccd1Q8BTU7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rccd1Q8BTU7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rccd1Q8BTU7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rccd1Q8BTU7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rccd1Q8BTU7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rccd1Q8BTU7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rccd1Q8BTU7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rccd1Q8BTU7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rccd1Q8BTU7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rccd1Q8BTU7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rccd1Q8BTU7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rccd1Q8BTU7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rccd1Q8BTU7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rccd1Q8BTU7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rccd1Q8BTU7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rccd1Q8BTU7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rccd1Q8BTU7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rccd1Q8BTU7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rccd1Q8BTU7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rccd1Q8BTU7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rccd1Q8BTU7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rccd1Q8BTU7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rccd1Q8BTU7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms