Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT3

Gcfc2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcfc2Q8BKT3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gcfc2Q8BKT3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gcfc2Q8BKT3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gcfc2Q8BKT3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gcfc2Q8BKT3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gcfc2Q8BKT3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gcfc2Q8BKT3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gcfc2Q8BKT3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gcfc2Q8BKT3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gcfc2Q8BKT3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gcfc2Q8BKT3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gcfc2Q8BKT3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gcfc2Q8BKT3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gcfc2Q8BKT3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gcfc2Q8BKT3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcfc2Q8BKT3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcfc2Q8BKT3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcfc2Q8BKT3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcfc2Q8BKT3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcfc2Q8BKT3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcfc2Q8BKT3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcfc2Q8BKT3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcfc2Q8BKT3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcfc2Q8BKT3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcfc2Q8BKT3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gcfc2Q8BKT3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gcfc2Q8BKT3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gcfc2Q8BKT3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gcfc2Q8BKT3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gcfc2Q8BKT3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gcfc2Q8BKT3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gcfc2Q8BKT3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gcfc2Q8BKT3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gcfc2Q8BKT3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcfc2Q8BKT3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcfc2Q8BKT3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcfc2Q8BKT3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcfc2Q8BKT3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcfc2Q8BKT3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcfc2Q8BKT3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcfc2Q8BKT3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcfc2Q8BKT3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcfc2Q8BKT3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcfc2Q8BKT3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcfc2Q8BKT3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcfc2Q8BKT3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcfc2Q8BKT3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcfc2Q8BKT3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcfc2Q8BKT3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcfc2Q8BKT3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcfc2Q8BKT3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcfc2Q8BKT3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcfc2Q8BKT3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcfc2Q8BKT3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcfc2Q8BKT3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcfc2Q8BKT3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcfc2Q8BKT3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcfc2Q8BKT3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcfc2Q8BKT3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcfc2Q8BKT3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcfc2Q8BKT3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcfc2Q8BKT3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcfc2Q8BKT3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcfc2Q8BKT3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcfc2Q8BKT3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcfc2Q8BKT3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcfc2Q8BKT3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcfc2Q8BKT3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcfc2Q8BKT3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gcfc2Q8BKT3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gcfc2Q8BKT3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gcfc2Q8BKT3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gcfc2Q8BKT3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gcfc2Q8BKT3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gcfc2Q8BKT3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gcfc2Q8BKT3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gcfc2Q8BKT3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gcfc2Q8BKT3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gcfc2Q8BKT3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gcfc2Q8BKT3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gcfc2Q8BKT3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gcfc2Q8BKT3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gcfc2Q8BKT3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gcfc2Q8BKT3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gcfc2Q8BKT3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gcfc2Q8BKT3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gcfc2Q8BKT3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gcfc2Q8BKT3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gcfc2Q8BKT3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcfc2Q8BKT3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcfc2Q8BKT3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcfc2Q8BKT3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcfc2Q8BKT3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcfc2Q8BKT3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcfc2Q8BKT3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcfc2Q8BKT3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcfc2Q8BKT3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcfc2Q8BKT3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gcfc2Q8BKT3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gcfc2Q8BKT3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms