Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIE6

Frmd4a, FERM domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd4aQ8BIE6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Frmd4aQ8BIE6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Frmd4aQ8BIE6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Frmd4aQ8BIE6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Frmd4aQ8BIE6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Frmd4aQ8BIE6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmd4aQ8BIE6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmd4aQ8BIE6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmd4aQ8BIE6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmd4aQ8BIE6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmd4aQ8BIE6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Frmd4aQ8BIE6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Frmd4aQ8BIE6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Frmd4aQ8BIE6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Frmd4aQ8BIE6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Frmd4aQ8BIE6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Frmd4aQ8BIE6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Frmd4aQ8BIE6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Frmd4aQ8BIE6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Frmd4aQ8BIE6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Frmd4aQ8BIE6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Frmd4aQ8BIE6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Frmd4aQ8BIE6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Frmd4aQ8BIE6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Frmd4aQ8BIE6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Frmd4aQ8BIE6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Frmd4aQ8BIE6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Frmd4aQ8BIE6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Frmd4aQ8BIE6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Frmd4aQ8BIE6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Frmd4aQ8BIE6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Frmd4aQ8BIE6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Frmd4aQ8BIE6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frmd4aQ8BIE6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frmd4aQ8BIE6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Frmd4aQ8BIE6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frmd4aQ8BIE6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frmd4aQ8BIE6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frmd4aQ8BIE6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmd4aQ8BIE6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmd4aQ8BIE6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmd4aQ8BIE6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmd4aQ8BIE6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmd4aQ8BIE6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmd4aQ8BIE6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmd4aQ8BIE6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmd4aQ8BIE6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmd4aQ8BIE6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmd4aQ8BIE6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmd4aQ8BIE6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmd4aQ8BIE6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmd4aQ8BIE6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmd4aQ8BIE6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmd4aQ8BIE6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Frmd4aQ8BIE6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Frmd4aQ8BIE6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms