Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHD4

Frmd3, FERM domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd3Q8BHD4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmd3Q8BHD4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmd3Q8BHD4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmd3Q8BHD4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmd3Q8BHD4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Frmd3Q8BHD4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Frmd3Q8BHD4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Frmd3Q8BHD4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Frmd3Q8BHD4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Frmd3Q8BHD4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Frmd3Q8BHD4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmd3Q8BHD4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmd3Q8BHD4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmd3Q8BHD4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmd3Q8BHD4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmd3Q8BHD4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Frmd3Q8BHD4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Frmd3Q8BHD4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Frmd3Q8BHD4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Frmd3Q8BHD4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Frmd3Q8BHD4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Frmd3Q8BHD4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Frmd3Q8BHD4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Frmd3Q8BHD4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Frmd3Q8BHD4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Frmd3Q8BHD4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Frmd3Q8BHD4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmd3Q8BHD4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmd3Q8BHD4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmd3Q8BHD4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmd3Q8BHD4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmd3Q8BHD4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmd3Q8BHD4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmd3Q8BHD4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmd3Q8BHD4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Frmd3Q8BHD4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Frmd3Q8BHD4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Frmd3Q8BHD4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Frmd3Q8BHD4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Frmd3Q8BHD4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Frmd3Q8BHD4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Frmd3Q8BHD4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Frmd3Q8BHD4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Frmd3Q8BHD4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Frmd3Q8BHD4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Frmd3Q8BHD4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Frmd3Q8BHD4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Frmd3Q8BHD4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Frmd3Q8BHD4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Frmd3Q8BHD4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Frmd3Q8BHD4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Frmd3Q8BHD4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Frmd3Q8BHD4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Frmd3Q8BHD4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Frmd3Q8BHD4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Frmd3Q8BHD4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Frmd3Q8BHD4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms