Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH75

Rnf41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf41Q8BH75 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rnf41Q8BH75 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rnf41Q8BH75 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rnf41Q8BH75 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rnf41Q8BH75 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rnf41Q8BH75 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rnf41Q8BH75 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rnf41Q8BH75 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rnf41Q8BH75 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rnf41Q8BH75 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rnf41Q8BH75 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rnf41Q8BH75 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rnf41Q8BH75 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rnf41Q8BH75 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rnf41Q8BH75 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rnf41Q8BH75 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rnf41Q8BH75 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rnf41Q8BH75 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rnf41Q8BH75 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rnf41Q8BH75 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rnf41Q8BH75 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rnf41Q8BH75 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rnf41Q8BH75 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf41Q8BH75 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf41Q8BH75 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf41Q8BH75 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf41Q8BH75 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf41Q8BH75 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf41Q8BH75 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf41Q8BH75 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf41Q8BH75 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf41Q8BH75 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf41Q8BH75 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf41Q8BH75 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf41Q8BH75 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf41Q8BH75 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf41Q8BH75 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf41Q8BH75 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rnf41Q8BH75 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rnf41Q8BH75 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rnf41Q8BH75 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rnf41Q8BH75 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rnf41Q8BH75 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rnf41Q8BH75 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rnf41Q8BH75 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rnf41Q8BH75 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rnf41Q8BH75 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rnf41Q8BH75 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rnf41Q8BH75 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf41Q8BH75 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf41Q8BH75 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf41Q8BH75 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf41Q8BH75 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf41Q8BH75 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf41Q8BH75 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rnf41Q8BH75 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rnf41Q8BH75 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Rnf41Q8BH75 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rnf41Q8BH75 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rnf41Q8BH75 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rnf41Q8BH75 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf41Q8BH75 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf41Q8BH75 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf41Q8BH75 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf41Q8BH75 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf41Q8BH75 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf41Q8BH75 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rnf41Q8BH75 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rnf41Q8BH75 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rnf41Q8BH75 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rnf41Q8BH75 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rnf41Q8BH75 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rnf41Q8BH75 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rnf41Q8BH75 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rnf41Q8BH75 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rnf41Q8BH75 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rnf41Q8BH75 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rnf41Q8BH75 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rnf41Q8BH75 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rnf41Q8BH75 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rnf41Q8BH75 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rnf41Q8BH75 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rnf41Q8BH75 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rnf41Q8BH75 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf41Q8BH75 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf41Q8BH75 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf41Q8BH75 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf41Q8BH75 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf41Q8BH75 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf41Q8BH75 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf41Q8BH75 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf41Q8BH75 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf41Q8BH75 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf41Q8BH75 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf41Q8BH75 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rnf41Q8BH75 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rnf41Q8BH75 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Rnf41Q8BH75 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rnf41Q8BH75 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rnf41Q8BH75 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms