Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGP6

Slc25a40, Solute carrier family 25 member 40, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc25a40Q8BGP6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc25a40Q8BGP6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc25a40Q8BGP6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc25a40Q8BGP6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc25a40Q8BGP6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc25a40Q8BGP6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms