Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD6

Slc38a9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a9Q8BGD6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc38a9Q8BGD6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc38a9Q8BGD6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc38a9Q8BGD6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc38a9Q8BGD6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc38a9Q8BGD6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc38a9Q8BGD6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc38a9Q8BGD6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc38a9Q8BGD6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc38a9Q8BGD6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc38a9Q8BGD6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc38a9Q8BGD6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc38a9Q8BGD6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc38a9Q8BGD6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc38a9Q8BGD6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc38a9Q8BGD6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc38a9Q8BGD6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc38a9Q8BGD6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc38a9Q8BGD6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc38a9Q8BGD6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc38a9Q8BGD6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc38a9Q8BGD6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc38a9Q8BGD6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc38a9Q8BGD6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc38a9Q8BGD6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc38a9Q8BGD6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc38a9Q8BGD6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc38a9Q8BGD6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc38a9Q8BGD6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc38a9Q8BGD6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc38a9Q8BGD6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc38a9Q8BGD6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc38a9Q8BGD6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc38a9Q8BGD6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc38a9Q8BGD6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc38a9Q8BGD6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc38a9Q8BGD6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc38a9Q8BGD6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc38a9Q8BGD6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc38a9Q8BGD6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc38a9Q8BGD6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc38a9Q8BGD6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc38a9Q8BGD6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc38a9Q8BGD6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc38a9Q8BGD6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc38a9Q8BGD6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc38a9Q8BGD6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc38a9Q8BGD6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc38a9Q8BGD6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc38a9Q8BGD6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc38a9Q8BGD6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc38a9Q8BGD6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc38a9Q8BGD6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc38a9Q8BGD6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc38a9Q8BGD6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc38a9Q8BGD6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc38a9Q8BGD6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc38a9Q8BGD6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc38a9Q8BGD6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc38a9Q8BGD6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc38a9Q8BGD6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc38a9Q8BGD6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc38a9Q8BGD6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc38a9Q8BGD6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc38a9Q8BGD6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc38a9Q8BGD6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc38a9Q8BGD6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc38a9Q8BGD6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc38a9Q8BGD6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc38a9Q8BGD6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc38a9Q8BGD6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc38a9Q8BGD6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc38a9Q8BGD6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc38a9Q8BGD6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc38a9Q8BGD6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc38a9Q8BGD6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc38a9Q8BGD6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc38a9Q8BGD6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc38a9Q8BGD6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc38a9Q8BGD6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc38a9Q8BGD6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc38a9Q8BGD6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc38a9Q8BGD6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc38a9Q8BGD6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc38a9Q8BGD6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc38a9Q8BGD6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc38a9Q8BGD6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc38a9Q8BGD6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc38a9Q8BGD6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc38a9Q8BGD6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc38a9Q8BGD6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc38a9Q8BGD6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc38a9Q8BGD6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc38a9Q8BGD6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc38a9Q8BGD6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc38a9Q8BGD6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc38a9Q8BGD6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc38a9Q8BGD6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc38a9Q8BGD6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc38a9Q8BGD6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms