Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFV3

Dusp4, Dual specificity protein phosphatase 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp4Q8BFV3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dusp4Q8BFV3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dusp4Q8BFV3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Dusp4Q8BFV3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dusp4Q8BFV3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dusp4Q8BFV3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Dusp4Q8BFV3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dusp4Q8BFV3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dusp4Q8BFV3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dusp4Q8BFV3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dusp4Q8BFV3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dusp4Q8BFV3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Dusp4Q8BFV3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dusp4Q8BFV3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dusp4Q8BFV3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dusp4Q8BFV3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dusp4Q8BFV3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dusp4Q8BFV3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dusp4Q8BFV3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dusp4Q8BFV3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dusp4Q8BFV3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dusp4Q8BFV3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dusp4Q8BFV3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dusp4Q8BFV3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Dusp4Q8BFV3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dusp4Q8BFV3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dusp4Q8BFV3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dusp4Q8BFV3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dusp4Q8BFV3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dusp4Q8BFV3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dusp4Q8BFV3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dusp4Q8BFV3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dusp4Q8BFV3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dusp4Q8BFV3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dusp4Q8BFV3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dusp4Q8BFV3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dusp4Q8BFV3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dusp4Q8BFV3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dusp4Q8BFV3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dusp4Q8BFV3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dusp4Q8BFV3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dusp4Q8BFV3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Dusp4Q8BFV3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dusp4Q8BFV3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dusp4Q8BFV3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dusp4Q8BFV3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dusp4Q8BFV3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dusp4Q8BFV3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dusp4Q8BFV3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dusp4Q8BFV3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dusp4Q8BFV3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dusp4Q8BFV3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dusp4Q8BFV3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dusp4Q8BFV3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dusp4Q8BFV3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dusp4Q8BFV3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Dusp4Q8BFV3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dusp4Q8BFV3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dusp4Q8BFV3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dusp4Q8BFV3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dusp4Q8BFV3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dusp4Q8BFV3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Dusp4Q8BFV3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dusp4Q8BFV3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dusp4Q8BFV3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dusp4Q8BFV3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dusp4Q8BFV3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dusp4Q8BFV3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dusp4Q8BFV3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dusp4Q8BFV3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dusp4Q8BFV3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dusp4Q8BFV3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dusp4Q8BFV3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dusp4Q8BFV3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dusp4Q8BFV3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dusp4Q8BFV3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dusp4Q8BFV3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dusp4Q8BFV3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dusp4Q8BFV3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dusp4Q8BFV3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dusp4Q8BFV3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dusp4Q8BFV3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dusp4Q8BFV3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Dusp4Q8BFV3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dusp4Q8BFV3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dusp4Q8BFV3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dusp4Q8BFV3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dusp4Q8BFV3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dusp4Q8BFV3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dusp4Q8BFV3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dusp4Q8BFV3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dusp4Q8BFV3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dusp4Q8BFV3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dusp4Q8BFV3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dusp4Q8BFV3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dusp4Q8BFV3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dusp4Q8BFV3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dusp4Q8BFV3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dusp4Q8BFV3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dusp4Q8BFV3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms