Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ChfrQ810L3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ChfrQ810L3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ChfrQ810L3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ChfrQ810L3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ChfrQ810L3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ChfrQ810L3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ChfrQ810L3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ChfrQ810L3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ChfrQ810L3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ChfrQ810L3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChfrQ810L3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChfrQ810L3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChfrQ810L3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChfrQ810L3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChfrQ810L3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChfrQ810L3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChfrQ810L3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChfrQ810L3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChfrQ810L3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChfrQ810L3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChfrQ810L3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChfrQ810L3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ChfrQ810L3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ChfrQ810L3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ChfrQ810L3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ChfrQ810L3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ChfrQ810L3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ChfrQ810L3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ChfrQ810L3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ChfrQ810L3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ChfrQ810L3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ChfrQ810L3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ChfrQ810L3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ChfrQ810L3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ChfrQ810L3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ChfrQ810L3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ChfrQ810L3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChfrQ810L3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ChfrQ810L3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ChfrQ810L3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChfrQ810L3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChfrQ810L3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChfrQ810L3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChfrQ810L3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChfrQ810L3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChfrQ810L3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChfrQ810L3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChfrQ810L3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChfrQ810L3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChfrQ810L3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChfrQ810L3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChfrQ810L3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChfrQ810L3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChfrQ810L3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChfrQ810L3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChfrQ810L3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChfrQ810L3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChfrQ810L3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChfrQ810L3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ChfrQ810L3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ChfrQ810L3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ChfrQ810L3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ChfrQ810L3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ChfrQ810L3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ChfrQ810L3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChfrQ810L3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChfrQ810L3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChfrQ810L3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChfrQ810L3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChfrQ810L3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChfrQ810L3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChfrQ810L3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChfrQ810L3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChfrQ810L3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChfrQ810L3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChfrQ810L3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChfrQ810L3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChfrQ810L3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChfrQ810L3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ChfrQ810L3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChfrQ810L3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChfrQ810L3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChfrQ810L3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChfrQ810L3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChfrQ810L3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChfrQ810L3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChfrQ810L3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChfrQ810L3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChfrQ810L3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChfrQ810L3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChfrQ810L3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChfrQ810L3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChfrQ810L3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChfrQ810L3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChfrQ810L3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChfrQ810L3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChfrQ810L3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChfrQ810L3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChfrQ810L3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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