Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zbed4Q80WQ9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zbed4Q80WQ9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zbed4Q80WQ9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zbed4Q80WQ9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zbed4Q80WQ9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zbed4Q80WQ9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zbed4Q80WQ9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zbed4Q80WQ9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zbed4Q80WQ9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zbed4Q80WQ9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zbed4Q80WQ9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zbed4Q80WQ9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zbed4Q80WQ9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zbed4Q80WQ9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zbed4Q80WQ9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zbed4Q80WQ9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zbed4Q80WQ9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zbed4Q80WQ9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zbed4Q80WQ9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zbed4Q80WQ9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zbed4Q80WQ9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zbed4Q80WQ9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zbed4Q80WQ9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zbed4Q80WQ9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zbed4Q80WQ9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Zbed4Q80WQ9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zbed4Q80WQ9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Zbed4Q80WQ9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zbed4Q80WQ9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zbed4Q80WQ9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zbed4Q80WQ9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zbed4Q80WQ9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zbed4Q80WQ9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zbed4Q80WQ9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zbed4Q80WQ9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zbed4Q80WQ9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zbed4Q80WQ9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zbed4Q80WQ9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zbed4Q80WQ9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zbed4Q80WQ9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zbed4Q80WQ9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zbed4Q80WQ9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zbed4Q80WQ9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zbed4Q80WQ9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zbed4Q80WQ9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zbed4Q80WQ9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zbed4Q80WQ9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zbed4Q80WQ9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zbed4Q80WQ9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zbed4Q80WQ9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zbed4Q80WQ9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zbed4Q80WQ9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Zbed4Q80WQ9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zbed4Q80WQ9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zbed4Q80WQ9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zbed4Q80WQ9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zbed4Q80WQ9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zbed4Q80WQ9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zbed4Q80WQ9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zbed4Q80WQ9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zbed4Q80WQ9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zbed4Q80WQ9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zbed4Q80WQ9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zbed4Q80WQ9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zbed4Q80WQ9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zbed4Q80WQ9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zbed4Q80WQ9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zbed4Q80WQ9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Zbed4Q80WQ9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zbed4Q80WQ9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zbed4Q80WQ9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zbed4Q80WQ9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zbed4Q80WQ9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zbed4Q80WQ9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zbed4Q80WQ9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zbed4Q80WQ9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zbed4Q80WQ9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zbed4Q80WQ9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zbed4Q80WQ9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zbed4Q80WQ9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zbed4Q80WQ9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zbed4Q80WQ9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zbed4Q80WQ9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zbed4Q80WQ9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Zbed4Q80WQ9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zbed4Q80WQ9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Zbed4Q80WQ9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zbed4Q80WQ9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zbed4Q80WQ9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zbed4Q80WQ9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zbed4Q80WQ9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zbed4Q80WQ9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zbed4Q80WQ9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zbed4Q80WQ9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zbed4Q80WQ9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zbed4Q80WQ9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zbed4Q80WQ9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zbed4Q80WQ9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zbed4Q80WQ9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms