Protein–RNA interactions for Protein: Q80WM3

Cplx4, Complexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cplx4Q80WM3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cplx4Q80WM3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cplx4Q80WM3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cplx4Q80WM3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cplx4Q80WM3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cplx4Q80WM3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cplx4Q80WM3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cplx4Q80WM3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cplx4Q80WM3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cplx4Q80WM3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cplx4Q80WM3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cplx4Q80WM3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cplx4Q80WM3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cplx4Q80WM3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cplx4Q80WM3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cplx4Q80WM3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cplx4Q80WM3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cplx4Q80WM3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cplx4Q80WM3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cplx4Q80WM3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cplx4Q80WM3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cplx4Q80WM3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cplx4Q80WM3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cplx4Q80WM3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cplx4Q80WM3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cplx4Q80WM3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cplx4Q80WM3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cplx4Q80WM3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cplx4Q80WM3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cplx4Q80WM3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cplx4Q80WM3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cplx4Q80WM3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cplx4Q80WM3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cplx4Q80WM3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cplx4Q80WM3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cplx4Q80WM3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cplx4Q80WM3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cplx4Q80WM3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cplx4Q80WM3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cplx4Q80WM3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cplx4Q80WM3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cplx4Q80WM3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cplx4Q80WM3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cplx4Q80WM3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cplx4Q80WM3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cplx4Q80WM3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cplx4Q80WM3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cplx4Q80WM3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cplx4Q80WM3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cplx4Q80WM3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cplx4Q80WM3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cplx4Q80WM3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cplx4Q80WM3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cplx4Q80WM3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cplx4Q80WM3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cplx4Q80WM3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cplx4Q80WM3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cplx4Q80WM3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cplx4Q80WM3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cplx4Q80WM3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cplx4Q80WM3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cplx4Q80WM3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cplx4Q80WM3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cplx4Q80WM3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cplx4Q80WM3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cplx4Q80WM3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cplx4Q80WM3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cplx4Q80WM3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cplx4Q80WM3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cplx4Q80WM3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cplx4Q80WM3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cplx4Q80WM3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cplx4Q80WM3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cplx4Q80WM3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cplx4Q80WM3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cplx4Q80WM3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cplx4Q80WM3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cplx4Q80WM3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cplx4Q80WM3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cplx4Q80WM3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cplx4Q80WM3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cplx4Q80WM3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cplx4Q80WM3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cplx4Q80WM3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cplx4Q80WM3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cplx4Q80WM3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cplx4Q80WM3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cplx4Q80WM3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cplx4Q80WM3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cplx4Q80WM3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cplx4Q80WM3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cplx4Q80WM3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cplx4Q80WM3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cplx4Q80WM3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cplx4Q80WM3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cplx4Q80WM3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cplx4Q80WM3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cplx4Q80WM3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cplx4Q80WM3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cplx4Q80WM3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms