Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG2

Plxna4, Plexin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 1,893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna4Q80UG2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Plxna4Q80UG2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Plxna4Q80UG2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Plxna4Q80UG2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Plxna4Q80UG2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Plxna4Q80UG2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Plxna4Q80UG2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Plxna4Q80UG2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Plxna4Q80UG2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Plxna4Q80UG2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Plxna4Q80UG2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Plxna4Q80UG2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Plxna4Q80UG2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Plxna4Q80UG2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Plxna4Q80UG2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Plxna4Q80UG2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Plxna4Q80UG2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Plxna4Q80UG2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Plxna4Q80UG2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Plxna4Q80UG2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Plxna4Q80UG2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Plxna4Q80UG2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Plxna4Q80UG2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Plxna4Q80UG2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Plxna4Q80UG2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Plxna4Q80UG2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Plxna4Q80UG2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Plxna4Q80UG2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Plxna4Q80UG2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Plxna4Q80UG2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Plxna4Q80UG2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Plxna4Q80UG2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Plxna4Q80UG2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Plxna4Q80UG2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Plxna4Q80UG2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Plxna4Q80UG2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Plxna4Q80UG2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Plxna4Q80UG2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Plxna4Q80UG2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Plxna4Q80UG2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Plxna4Q80UG2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Plxna4Q80UG2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Plxna4Q80UG2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Plxna4Q80UG2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Plxna4Q80UG2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Plxna4Q80UG2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Plxna4Q80UG2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Plxna4Q80UG2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Plxna4Q80UG2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Plxna4Q80UG2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Plxna4Q80UG2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Plxna4Q80UG2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Plxna4Q80UG2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Plxna4Q80UG2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plxna4Q80UG2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plxna4Q80UG2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plxna4Q80UG2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Plxna4Q80UG2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Plxna4Q80UG2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plxna4Q80UG2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Plxna4Q80UG2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Plxna4Q80UG2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Plxna4Q80UG2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Plxna4Q80UG2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Plxna4Q80UG2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Plxna4Q80UG2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Plxna4Q80UG2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Plxna4Q80UG2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Plxna4Q80UG2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Plxna4Q80UG2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Plxna4Q80UG2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Plxna4Q80UG2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Plxna4Q80UG2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Plxna4Q80UG2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Plxna4Q80UG2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Plxna4Q80UG2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Plxna4Q80UG2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Plxna4Q80UG2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Plxna4Q80UG2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Plxna4Q80UG2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Plxna4Q80UG2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Plxna4Q80UG2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Plxna4Q80UG2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Plxna4Q80UG2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Plxna4Q80UG2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Plxna4Q80UG2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Plxna4Q80UG2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Plxna4Q80UG2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Plxna4Q80UG2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Plxna4Q80UG2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Plxna4Q80UG2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Plxna4Q80UG2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Plxna4Q80UG2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Plxna4Q80UG2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Plxna4Q80UG2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Plxna4Q80UG2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Plxna4Q80UG2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Plxna4Q80UG2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Plxna4Q80UG2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Plxna4Q80UG2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms