Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ube3cQ80U95 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ube3cQ80U95 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ube3cQ80U95 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ube3cQ80U95 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ube3cQ80U95 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ube3cQ80U95 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ube3cQ80U95 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ube3cQ80U95 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ube3cQ80U95 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ube3cQ80U95 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ube3cQ80U95 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ube3cQ80U95 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ube3cQ80U95 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ube3cQ80U95 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ube3cQ80U95 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ube3cQ80U95 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ube3cQ80U95 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ube3cQ80U95 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ube3cQ80U95 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ube3cQ80U95 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ube3cQ80U95 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ube3cQ80U95 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ube3cQ80U95 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ube3cQ80U95 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ube3cQ80U95 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ube3cQ80U95 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ube3cQ80U95 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ube3cQ80U95 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ube3cQ80U95 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ube3cQ80U95 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ube3cQ80U95 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ube3cQ80U95 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ube3cQ80U95 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ube3cQ80U95 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ube3cQ80U95 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ube3cQ80U95 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ube3cQ80U95 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ube3cQ80U95 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ube3cQ80U95 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ube3cQ80U95 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ube3cQ80U95 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ube3cQ80U95 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ube3cQ80U95 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ube3cQ80U95 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ube3cQ80U95 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ube3cQ80U95 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ube3cQ80U95 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ube3cQ80U95 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ube3cQ80U95 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ube3cQ80U95 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ube3cQ80U95 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ube3cQ80U95 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ube3cQ80U95 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ube3cQ80U95 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ube3cQ80U95 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ube3cQ80U95 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ube3cQ80U95 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ube3cQ80U95 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ube3cQ80U95 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ube3cQ80U95 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ube3cQ80U95 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ube3cQ80U95 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ube3cQ80U95 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ube3cQ80U95 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ube3cQ80U95 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ube3cQ80U95 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ube3cQ80U95 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ube3cQ80U95 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ube3cQ80U95 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ube3cQ80U95 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ube3cQ80U95 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ube3cQ80U95 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ube3cQ80U95 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ube3cQ80U95 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ube3cQ80U95 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ube3cQ80U95 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ube3cQ80U95 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ube3cQ80U95 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ube3cQ80U95 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ube3cQ80U95 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ube3cQ80U95 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ube3cQ80U95 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ube3cQ80U95 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ube3cQ80U95 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ube3cQ80U95 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ube3cQ80U95 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ube3cQ80U95 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ube3cQ80U95 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ube3cQ80U95 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ube3cQ80U95 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ube3cQ80U95 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ube3cQ80U95 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ube3cQ80U95 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ube3cQ80U95 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ube3cQ80U95 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ube3cQ80U95 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ube3cQ80U95 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ube3cQ80U95 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ube3cQ80U95 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms