Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Cdc42bpbQ7TT50 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Cdc42bpbQ7TT50 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Cdc42bpbQ7TT50 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Cdc42bpbQ7TT50 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Cdc42bpbQ7TT50 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Cdc42bpbQ7TT50 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Cdc42bpbQ7TT50 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Cdc42bpbQ7TT50 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Cdc42bpbQ7TT50 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC32,53■■■□□ 2,8
Cdc42bpbQ7TT50 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32,52■■■□□ 2,8
Cdc42bpbQ7TT50 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Cdc42bpbQ7TT50 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC32,51■■■□□ 2,8
Cdc42bpbQ7TT50 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,8
Cdc42bpbQ7TT50 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,8
Cdc42bpbQ7TT50 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Cdc42bpbQ7TT50 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC32,51■■■□□ 2,79
Cdc42bpbQ7TT50 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC32,5■■■□□ 2,79
Cdc42bpbQ7TT50 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC32,5■■■□□ 2,79
Cdc42bpbQ7TT50 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Cdc42bpbQ7TT50 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32,49■■■□□ 2,79
Cdc42bpbQ7TT50 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Cdc42bpbQ7TT50 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC32,49■■■□□ 2,79
Cdc42bpbQ7TT50 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Cdc42bpbQ7TT50 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC32,48■■■□□ 2,79
Cdc42bpbQ7TT50 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
Cdc42bpbQ7TT50 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
Cdc42bpbQ7TT50 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
Cdc42bpbQ7TT50 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
Cdc42bpbQ7TT50 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
Cdc42bpbQ7TT50 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC32,47■■■□□ 2,79
Cdc42bpbQ7TT50 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
Cdc42bpbQ7TT50 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC32,46■■■□□ 2,79
Cdc42bpbQ7TT50 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC32,46■■■□□ 2,79
Cdc42bpbQ7TT50 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
Cdc42bpbQ7TT50 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
Cdc42bpbQ7TT50 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
Cdc42bpbQ7TT50 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC32,46■■■□□ 2,79
Cdc42bpbQ7TT50 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,79
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,78
Cdc42bpbQ7TT50 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
Cdc42bpbQ7TT50 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Cdc42bpbQ7TT50 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Cdc42bpbQ7TT50 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Cdc42bpbQ7TT50 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Cdc42bpbQ7TT50 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Cdc42bpbQ7TT50 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC32,42■■■□□ 2,78
Cdc42bpbQ7TT50 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Cdc42bpbQ7TT50 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Cdc42bpbQ7TT50 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC32,41■■■□□ 2,78
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
Cdc42bpbQ7TT50 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
Cdc42bpbQ7TT50 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
Cdc42bpbQ7TT50 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32,39■■■□□ 2,78
Cdc42bpbQ7TT50 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC32,39■■■□□ 2,78
Cdc42bpbQ7TT50 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Cdc42bpbQ7TT50 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC32,38■■■□□ 2,77
Cdc42bpbQ7TT50 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Cdc42bpbQ7TT50 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Cdc42bpbQ7TT50 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Cdc42bpbQ7TT50 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
Cdc42bpbQ7TT50 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
Cdc42bpbQ7TT50 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
Cdc42bpbQ7TT50 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
Cdc42bpbQ7TT50 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
Cdc42bpbQ7TT50 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC32,36■■■□□ 2,77
Cdc42bpbQ7TT50 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,35■■■□□ 2,77
Cdc42bpbQ7TT50 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC32,35■■■□□ 2,77
Cdc42bpbQ7TT50 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC32,34■■■□□ 2,77
Cdc42bpbQ7TT50 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Cdc42bpbQ7TT50 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Cdc42bpbQ7TT50 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC32,34■■■□□ 2,77
Cdc42bpbQ7TT50 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC32,33■■■□□ 2,77
Cdc42bpbQ7TT50 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
Cdc42bpbQ7TT50 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
Cdc42bpbQ7TT50 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC32,32■■■□□ 2,76
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC32,32■■■□□ 2,76
Cdc42bpbQ7TT50 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32,32■■■□□ 2,76
Cdc42bpbQ7TT50 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
Cdc42bpbQ7TT50 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
Cdc42bpbQ7TT50 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC32,31■■■□□ 2,76
Cdc42bpbQ7TT50 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC32,31■■■□□ 2,76
Cdc42bpbQ7TT50 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,31■■■□□ 2,76
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC32,31■■■□□ 2,76
Cdc42bpbQ7TT50 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Cdc42bpbQ7TT50 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC32,29■■■□□ 2,76
Cdc42bpbQ7TT50 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Cdc42bpbQ7TT50 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
Cdc42bpbQ7TT50 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
Cdc42bpbQ7TT50 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC32,26■■■□□ 2,76
Cdc42bpbQ7TT50 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC32,26■■■□□ 2,76
Cdc42bpbQ7TT50 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC32,26■■■□□ 2,76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms