Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Actn1Q7TPR4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Actn1Q7TPR4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Actn1Q7TPR4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Actn1Q7TPR4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Actn1Q7TPR4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Actn1Q7TPR4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Actn1Q7TPR4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Actn1Q7TPR4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Actn1Q7TPR4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Actn1Q7TPR4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Actn1Q7TPR4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Actn1Q7TPR4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Actn1Q7TPR4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Actn1Q7TPR4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Actn1Q7TPR4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Actn1Q7TPR4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Actn1Q7TPR4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Actn1Q7TPR4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Actn1Q7TPR4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Actn1Q7TPR4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Actn1Q7TPR4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Actn1Q7TPR4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Actn1Q7TPR4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Actn1Q7TPR4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Actn1Q7TPR4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Actn1Q7TPR4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Actn1Q7TPR4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Actn1Q7TPR4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Actn1Q7TPR4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Actn1Q7TPR4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Actn1Q7TPR4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Actn1Q7TPR4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Actn1Q7TPR4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Actn1Q7TPR4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Actn1Q7TPR4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Actn1Q7TPR4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Actn1Q7TPR4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Actn1Q7TPR4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Actn1Q7TPR4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Actn1Q7TPR4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Actn1Q7TPR4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Actn1Q7TPR4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Actn1Q7TPR4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Actn1Q7TPR4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Actn1Q7TPR4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Actn1Q7TPR4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Actn1Q7TPR4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Actn1Q7TPR4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Actn1Q7TPR4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Actn1Q7TPR4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Actn1Q7TPR4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Actn1Q7TPR4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Actn1Q7TPR4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Actn1Q7TPR4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Actn1Q7TPR4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Actn1Q7TPR4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Actn1Q7TPR4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Actn1Q7TPR4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Actn1Q7TPR4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Actn1Q7TPR4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Actn1Q7TPR4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Actn1Q7TPR4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Actn1Q7TPR4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Actn1Q7TPR4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Actn1Q7TPR4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Actn1Q7TPR4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Actn1Q7TPR4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Actn1Q7TPR4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Actn1Q7TPR4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Actn1Q7TPR4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Actn1Q7TPR4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Actn1Q7TPR4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Actn1Q7TPR4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Actn1Q7TPR4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Actn1Q7TPR4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Actn1Q7TPR4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Actn1Q7TPR4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Actn1Q7TPR4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Actn1Q7TPR4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Actn1Q7TPR4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Actn1Q7TPR4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Actn1Q7TPR4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Actn1Q7TPR4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Actn1Q7TPR4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Actn1Q7TPR4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Actn1Q7TPR4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Actn1Q7TPR4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Actn1Q7TPR4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Actn1Q7TPR4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Actn1Q7TPR4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Actn1Q7TPR4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Actn1Q7TPR4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Actn1Q7TPR4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Actn1Q7TPR4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Actn1Q7TPR4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Actn1Q7TPR4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Actn1Q7TPR4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Actn1Q7TPR4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Actn1Q7TPR4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms