Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN37

Trpm4, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm4Q7TN37 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpm4Q7TN37 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpm4Q7TN37 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpm4Q7TN37 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpm4Q7TN37 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpm4Q7TN37 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpm4Q7TN37 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpm4Q7TN37 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpm4Q7TN37 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpm4Q7TN37 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpm4Q7TN37 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpm4Q7TN37 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpm4Q7TN37 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpm4Q7TN37 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpm4Q7TN37 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpm4Q7TN37 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpm4Q7TN37 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpm4Q7TN37 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpm4Q7TN37 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpm4Q7TN37 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpm4Q7TN37 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpm4Q7TN37 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpm4Q7TN37 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpm4Q7TN37 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpm4Q7TN37 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpm4Q7TN37 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpm4Q7TN37 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpm4Q7TN37 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm4Q7TN37 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm4Q7TN37 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm4Q7TN37 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm4Q7TN37 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpm4Q7TN37 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpm4Q7TN37 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpm4Q7TN37 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpm4Q7TN37 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpm4Q7TN37 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpm4Q7TN37 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpm4Q7TN37 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpm4Q7TN37 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Trpm4Q7TN37 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpm4Q7TN37 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Trpm4Q7TN37 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpm4Q7TN37 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpm4Q7TN37 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpm4Q7TN37 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpm4Q7TN37 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpm4Q7TN37 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpm4Q7TN37 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpm4Q7TN37 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpm4Q7TN37 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpm4Q7TN37 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpm4Q7TN37 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms