Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf139Q7TMV1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf139Q7TMV1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf139Q7TMV1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf139Q7TMV1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf139Q7TMV1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf139Q7TMV1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf139Q7TMV1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf139Q7TMV1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf139Q7TMV1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf139Q7TMV1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf139Q7TMV1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf139Q7TMV1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf139Q7TMV1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf139Q7TMV1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf139Q7TMV1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf139Q7TMV1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf139Q7TMV1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf139Q7TMV1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf139Q7TMV1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf139Q7TMV1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf139Q7TMV1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf139Q7TMV1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rnf139Q7TMV1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf139Q7TMV1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf139Q7TMV1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf139Q7TMV1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf139Q7TMV1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf139Q7TMV1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf139Q7TMV1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf139Q7TMV1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf139Q7TMV1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf139Q7TMV1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf139Q7TMV1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf139Q7TMV1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf139Q7TMV1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf139Q7TMV1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf139Q7TMV1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf139Q7TMV1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf139Q7TMV1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf139Q7TMV1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf139Q7TMV1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf139Q7TMV1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf139Q7TMV1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf139Q7TMV1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf139Q7TMV1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf139Q7TMV1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf139Q7TMV1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf139Q7TMV1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf139Q7TMV1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf139Q7TMV1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf139Q7TMV1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf139Q7TMV1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf139Q7TMV1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf139Q7TMV1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf139Q7TMV1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf139Q7TMV1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf139Q7TMV1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf139Q7TMV1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf139Q7TMV1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf139Q7TMV1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf139Q7TMV1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf139Q7TMV1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf139Q7TMV1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf139Q7TMV1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf139Q7TMV1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf139Q7TMV1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf139Q7TMV1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf139Q7TMV1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf139Q7TMV1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf139Q7TMV1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf139Q7TMV1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf139Q7TMV1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf139Q7TMV1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf139Q7TMV1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf139Q7TMV1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf139Q7TMV1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf139Q7TMV1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf139Q7TMV1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf139Q7TMV1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf139Q7TMV1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf139Q7TMV1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf139Q7TMV1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf139Q7TMV1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf139Q7TMV1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf139Q7TMV1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf139Q7TMV1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf139Q7TMV1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf139Q7TMV1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf139Q7TMV1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf139Q7TMV1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf139Q7TMV1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf139Q7TMV1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf139Q7TMV1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf139Q7TMV1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf139Q7TMV1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf139Q7TMV1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf139Q7TMV1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf139Q7TMV1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf139Q7TMV1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms