Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ssh1Q76I79 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ssh1Q76I79 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ssh1Q76I79 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ssh1Q76I79 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ssh1Q76I79 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ssh1Q76I79 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ssh1Q76I79 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ssh1Q76I79 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ssh1Q76I79 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ssh1Q76I79 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ssh1Q76I79 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ssh1Q76I79 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ssh1Q76I79 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ssh1Q76I79 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ssh1Q76I79 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ssh1Q76I79 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ssh1Q76I79 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ssh1Q76I79 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ssh1Q76I79 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ssh1Q76I79 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ssh1Q76I79 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ssh1Q76I79 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ssh1Q76I79 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ssh1Q76I79 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ssh1Q76I79 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ssh1Q76I79 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ssh1Q76I79 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ssh1Q76I79 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ssh1Q76I79 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ssh1Q76I79 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ssh1Q76I79 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ssh1Q76I79 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ssh1Q76I79 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ssh1Q76I79 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ssh1Q76I79 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ssh1Q76I79 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ssh1Q76I79 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ssh1Q76I79 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ssh1Q76I79 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ssh1Q76I79 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ssh1Q76I79 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ssh1Q76I79 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ssh1Q76I79 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ssh1Q76I79 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ssh1Q76I79 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ssh1Q76I79 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ssh1Q76I79 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ssh1Q76I79 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ssh1Q76I79 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ssh1Q76I79 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ssh1Q76I79 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ssh1Q76I79 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ssh1Q76I79 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ssh1Q76I79 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ssh1Q76I79 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ssh1Q76I79 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ssh1Q76I79 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ssh1Q76I79 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ssh1Q76I79 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ssh1Q76I79 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ssh1Q76I79 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ssh1Q76I79 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ssh1Q76I79 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ssh1Q76I79 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ssh1Q76I79 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ssh1Q76I79 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ssh1Q76I79 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ssh1Q76I79 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ssh1Q76I79 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ssh1Q76I79 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ssh1Q76I79 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ssh1Q76I79 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ssh1Q76I79 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ssh1Q76I79 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ssh1Q76I79 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ssh1Q76I79 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ssh1Q76I79 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ssh1Q76I79 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ssh1Q76I79 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ssh1Q76I79 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ssh1Q76I79 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ssh1Q76I79 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ssh1Q76I79 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ssh1Q76I79 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ssh1Q76I79 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ssh1Q76I79 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ssh1Q76I79 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ssh1Q76I79 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ssh1Q76I79 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ssh1Q76I79 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ssh1Q76I79 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ssh1Q76I79 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ssh1Q76I79 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ssh1Q76I79 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ssh1Q76I79 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ssh1Q76I79 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ssh1Q76I79 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ssh1Q76I79 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ssh1Q76I79 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms