Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cspg5Q71M36 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cspg5Q71M36 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cspg5Q71M36 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cspg5Q71M36 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cspg5Q71M36 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cspg5Q71M36 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cspg5Q71M36 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cspg5Q71M36 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cspg5Q71M36 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cspg5Q71M36 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cspg5Q71M36 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cspg5Q71M36 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cspg5Q71M36 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cspg5Q71M36 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cspg5Q71M36 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cspg5Q71M36 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cspg5Q71M36 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cspg5Q71M36 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cspg5Q71M36 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cspg5Q71M36 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cspg5Q71M36 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cspg5Q71M36 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cspg5Q71M36 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cspg5Q71M36 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cspg5Q71M36 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cspg5Q71M36 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cspg5Q71M36 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cspg5Q71M36 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cspg5Q71M36 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cspg5Q71M36 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cspg5Q71M36 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cspg5Q71M36 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cspg5Q71M36 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cspg5Q71M36 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cspg5Q71M36 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cspg5Q71M36 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cspg5Q71M36 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cspg5Q71M36 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cspg5Q71M36 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cspg5Q71M36 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cspg5Q71M36 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cspg5Q71M36 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cspg5Q71M36 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cspg5Q71M36 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cspg5Q71M36 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cspg5Q71M36 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cspg5Q71M36 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cspg5Q71M36 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cspg5Q71M36 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cspg5Q71M36 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cspg5Q71M36 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cspg5Q71M36 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cspg5Q71M36 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cspg5Q71M36 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cspg5Q71M36 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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