Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cnih3Q6ZWS4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnih3Q6ZWS4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnih3Q6ZWS4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cnih3Q6ZWS4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnih3Q6ZWS4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnih3Q6ZWS4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnih3Q6ZWS4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnih3Q6ZWS4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnih3Q6ZWS4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnih3Q6ZWS4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnih3Q6ZWS4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnih3Q6ZWS4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnih3Q6ZWS4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnih3Q6ZWS4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnih3Q6ZWS4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnih3Q6ZWS4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnih3Q6ZWS4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnih3Q6ZWS4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnih3Q6ZWS4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnih3Q6ZWS4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnih3Q6ZWS4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnih3Q6ZWS4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnih3Q6ZWS4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnih3Q6ZWS4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnih3Q6ZWS4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnih3Q6ZWS4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnih3Q6ZWS4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnih3Q6ZWS4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnih3Q6ZWS4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnih3Q6ZWS4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnih3Q6ZWS4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnih3Q6ZWS4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnih3Q6ZWS4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnih3Q6ZWS4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnih3Q6ZWS4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnih3Q6ZWS4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnih3Q6ZWS4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnih3Q6ZWS4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnih3Q6ZWS4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnih3Q6ZWS4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnih3Q6ZWS4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnih3Q6ZWS4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnih3Q6ZWS4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnih3Q6ZWS4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnih3Q6ZWS4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnih3Q6ZWS4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnih3Q6ZWS4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnih3Q6ZWS4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnih3Q6ZWS4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnih3Q6ZWS4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnih3Q6ZWS4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnih3Q6ZWS4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnih3Q6ZWS4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnih3Q6ZWS4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnih3Q6ZWS4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnih3Q6ZWS4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnih3Q6ZWS4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnih3Q6ZWS4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnih3Q6ZWS4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnih3Q6ZWS4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnih3Q6ZWS4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnih3Q6ZWS4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnih3Q6ZWS4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnih3Q6ZWS4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnih3Q6ZWS4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnih3Q6ZWS4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnih3Q6ZWS4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnih3Q6ZWS4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnih3Q6ZWS4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnih3Q6ZWS4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnih3Q6ZWS4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnih3Q6ZWS4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnih3Q6ZWS4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnih3Q6ZWS4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnih3Q6ZWS4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnih3Q6ZWS4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnih3Q6ZWS4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnih3Q6ZWS4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnih3Q6ZWS4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnih3Q6ZWS4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnih3Q6ZWS4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnih3Q6ZWS4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnih3Q6ZWS4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnih3Q6ZWS4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnih3Q6ZWS4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnih3Q6ZWS4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnih3Q6ZWS4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnih3Q6ZWS4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnih3Q6ZWS4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnih3Q6ZWS4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnih3Q6ZWS4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnih3Q6ZWS4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnih3Q6ZWS4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnih3Q6ZWS4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnih3Q6ZWS4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnih3Q6ZWS4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnih3Q6ZWS4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnih3Q6ZWS4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnih3Q6ZWS4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms