Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RfflQ6ZQM0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RfflQ6ZQM0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RfflQ6ZQM0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RfflQ6ZQM0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RfflQ6ZQM0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RfflQ6ZQM0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RfflQ6ZQM0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RfflQ6ZQM0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RfflQ6ZQM0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RfflQ6ZQM0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RfflQ6ZQM0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RfflQ6ZQM0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RfflQ6ZQM0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RfflQ6ZQM0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RfflQ6ZQM0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RfflQ6ZQM0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RfflQ6ZQM0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RfflQ6ZQM0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RfflQ6ZQM0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RfflQ6ZQM0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RfflQ6ZQM0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RfflQ6ZQM0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RfflQ6ZQM0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RfflQ6ZQM0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RfflQ6ZQM0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RfflQ6ZQM0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RfflQ6ZQM0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RfflQ6ZQM0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RfflQ6ZQM0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RfflQ6ZQM0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RfflQ6ZQM0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RfflQ6ZQM0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RfflQ6ZQM0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RfflQ6ZQM0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RfflQ6ZQM0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RfflQ6ZQM0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RfflQ6ZQM0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
RfflQ6ZQM0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RfflQ6ZQM0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RfflQ6ZQM0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RfflQ6ZQM0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RfflQ6ZQM0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RfflQ6ZQM0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RfflQ6ZQM0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RfflQ6ZQM0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RfflQ6ZQM0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RfflQ6ZQM0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RfflQ6ZQM0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RfflQ6ZQM0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RfflQ6ZQM0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RfflQ6ZQM0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.8 ms