Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp34Q6ZQ93 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp34Q6ZQ93 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp34Q6ZQ93 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp34Q6ZQ93 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp34Q6ZQ93 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp34Q6ZQ93 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp34Q6ZQ93 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp34Q6ZQ93 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp34Q6ZQ93 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp34Q6ZQ93 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp34Q6ZQ93 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp34Q6ZQ93 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp34Q6ZQ93 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp34Q6ZQ93 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp34Q6ZQ93 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Usp34Q6ZQ93 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Usp34Q6ZQ93 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp34Q6ZQ93 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp34Q6ZQ93 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp34Q6ZQ93 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp34Q6ZQ93 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp34Q6ZQ93 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp34Q6ZQ93 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp34Q6ZQ93 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp34Q6ZQ93 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp34Q6ZQ93 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp34Q6ZQ93 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp34Q6ZQ93 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp34Q6ZQ93 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp34Q6ZQ93 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp34Q6ZQ93 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp34Q6ZQ93 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp34Q6ZQ93 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp34Q6ZQ93 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp34Q6ZQ93 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp34Q6ZQ93 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp34Q6ZQ93 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp34Q6ZQ93 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp34Q6ZQ93 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp34Q6ZQ93 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp34Q6ZQ93 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp34Q6ZQ93 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp34Q6ZQ93 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp34Q6ZQ93 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp34Q6ZQ93 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp34Q6ZQ93 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp34Q6ZQ93 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp34Q6ZQ93 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp34Q6ZQ93 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp34Q6ZQ93 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp34Q6ZQ93 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp34Q6ZQ93 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp34Q6ZQ93 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp34Q6ZQ93 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms