Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efr3bQ6ZQ18 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efr3bQ6ZQ18 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efr3bQ6ZQ18 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Efr3bQ6ZQ18 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Efr3bQ6ZQ18 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Efr3bQ6ZQ18 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Efr3bQ6ZQ18 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Efr3bQ6ZQ18 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efr3bQ6ZQ18 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efr3bQ6ZQ18 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efr3bQ6ZQ18 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efr3bQ6ZQ18 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efr3bQ6ZQ18 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efr3bQ6ZQ18 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efr3bQ6ZQ18 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efr3bQ6ZQ18 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efr3bQ6ZQ18 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efr3bQ6ZQ18 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efr3bQ6ZQ18 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efr3bQ6ZQ18 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efr3bQ6ZQ18 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efr3bQ6ZQ18 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efr3bQ6ZQ18 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efr3bQ6ZQ18 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efr3bQ6ZQ18 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efr3bQ6ZQ18 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efr3bQ6ZQ18 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efr3bQ6ZQ18 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efr3bQ6ZQ18 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efr3bQ6ZQ18 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efr3bQ6ZQ18 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efr3bQ6ZQ18 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efr3bQ6ZQ18 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efr3bQ6ZQ18 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efr3bQ6ZQ18 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efr3bQ6ZQ18 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efr3bQ6ZQ18 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efr3bQ6ZQ18 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efr3bQ6ZQ18 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efr3bQ6ZQ18 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Efr3bQ6ZQ18 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efr3bQ6ZQ18 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efr3bQ6ZQ18 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efr3bQ6ZQ18 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efr3bQ6ZQ18 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms