Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NinlQ6ZQ12 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
NinlQ6ZQ12 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NinlQ6ZQ12 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NinlQ6ZQ12 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NinlQ6ZQ12 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NinlQ6ZQ12 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NinlQ6ZQ12 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NinlQ6ZQ12 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NinlQ6ZQ12 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NinlQ6ZQ12 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NinlQ6ZQ12 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NinlQ6ZQ12 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NinlQ6ZQ12 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NinlQ6ZQ12 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NinlQ6ZQ12 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NinlQ6ZQ12 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NinlQ6ZQ12 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NinlQ6ZQ12 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NinlQ6ZQ12 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NinlQ6ZQ12 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC30■■■□□ 2.39
NinlQ6ZQ12 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NinlQ6ZQ12 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NinlQ6ZQ12 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NinlQ6ZQ12 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NinlQ6ZQ12 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NinlQ6ZQ12 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NinlQ6ZQ12 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NinlQ6ZQ12 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NinlQ6ZQ12 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NinlQ6ZQ12 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NinlQ6ZQ12 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NinlQ6ZQ12 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NinlQ6ZQ12 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NinlQ6ZQ12 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NinlQ6ZQ12 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NinlQ6ZQ12 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
NinlQ6ZQ12 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NinlQ6ZQ12 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NinlQ6ZQ12 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NinlQ6ZQ12 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NinlQ6ZQ12 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NinlQ6ZQ12 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NinlQ6ZQ12 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NinlQ6ZQ12 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NinlQ6ZQ12 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NinlQ6ZQ12 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NinlQ6ZQ12 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NinlQ6ZQ12 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NinlQ6ZQ12 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NinlQ6ZQ12 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NinlQ6ZQ12 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NinlQ6ZQ12 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NinlQ6ZQ12 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NinlQ6ZQ12 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NinlQ6ZQ12 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NinlQ6ZQ12 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NinlQ6ZQ12 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NinlQ6ZQ12 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NinlQ6ZQ12 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NinlQ6ZQ12 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NinlQ6ZQ12 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NinlQ6ZQ12 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NinlQ6ZQ12 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NinlQ6ZQ12 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NinlQ6ZQ12 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NinlQ6ZQ12 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NinlQ6ZQ12 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NinlQ6ZQ12 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
NinlQ6ZQ12 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NinlQ6ZQ12 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NinlQ6ZQ12 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NinlQ6ZQ12 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NinlQ6ZQ12 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NinlQ6ZQ12 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NinlQ6ZQ12 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NinlQ6ZQ12 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NinlQ6ZQ12 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NinlQ6ZQ12 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NinlQ6ZQ12 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NinlQ6ZQ12 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
NinlQ6ZQ12 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NinlQ6ZQ12 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NinlQ6ZQ12 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NinlQ6ZQ12 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NinlQ6ZQ12 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NinlQ6ZQ12 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NinlQ6ZQ12 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NinlQ6ZQ12 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NinlQ6ZQ12 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NinlQ6ZQ12 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NinlQ6ZQ12 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NinlQ6ZQ12 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NinlQ6ZQ12 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NinlQ6ZQ12 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NinlQ6ZQ12 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NinlQ6ZQ12 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NinlQ6ZQ12 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NinlQ6ZQ12 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NinlQ6ZQ12 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
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