Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY2

Smg5, Protein SMG5, mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg5Q6ZPY2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smg5Q6ZPY2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smg5Q6ZPY2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smg5Q6ZPY2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg5Q6ZPY2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg5Q6ZPY2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg5Q6ZPY2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smg5Q6ZPY2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smg5Q6ZPY2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smg5Q6ZPY2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smg5Q6ZPY2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smg5Q6ZPY2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smg5Q6ZPY2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smg5Q6ZPY2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smg5Q6ZPY2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smg5Q6ZPY2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smg5Q6ZPY2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smg5Q6ZPY2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smg5Q6ZPY2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smg5Q6ZPY2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg5Q6ZPY2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg5Q6ZPY2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg5Q6ZPY2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg5Q6ZPY2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg5Q6ZPY2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg5Q6ZPY2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg5Q6ZPY2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg5Q6ZPY2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg5Q6ZPY2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg5Q6ZPY2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg5Q6ZPY2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg5Q6ZPY2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg5Q6ZPY2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg5Q6ZPY2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg5Q6ZPY2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smg5Q6ZPY2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Smg5Q6ZPY2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smg5Q6ZPY2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smg5Q6ZPY2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Smg5Q6ZPY2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smg5Q6ZPY2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smg5Q6ZPY2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smg5Q6ZPY2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smg5Q6ZPY2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smg5Q6ZPY2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Smg5Q6ZPY2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smg5Q6ZPY2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smg5Q6ZPY2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Smg5Q6ZPY2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smg5Q6ZPY2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smg5Q6ZPY2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smg5Q6ZPY2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smg5Q6ZPY2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Smg5Q6ZPY2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smg5Q6ZPY2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms