Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Slc44a1Q6X893 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Slc44a1Q6X893 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc44a1Q6X893 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc44a1Q6X893 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc44a1Q6X893 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc44a1Q6X893 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc44a1Q6X893 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc44a1Q6X893 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc44a1Q6X893 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc44a1Q6X893 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc44a1Q6X893 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc44a1Q6X893 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc44a1Q6X893 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc44a1Q6X893 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc44a1Q6X893 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc44a1Q6X893 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc44a1Q6X893 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc44a1Q6X893 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc44a1Q6X893 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc44a1Q6X893 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc44a1Q6X893 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc44a1Q6X893 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc44a1Q6X893 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc44a1Q6X893 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc44a1Q6X893 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc44a1Q6X893 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc44a1Q6X893 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc44a1Q6X893 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc44a1Q6X893 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc44a1Q6X893 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc44a1Q6X893 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc44a1Q6X893 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc44a1Q6X893 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc44a1Q6X893 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc44a1Q6X893 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc44a1Q6X893 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc44a1Q6X893 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc44a1Q6X893 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc44a1Q6X893 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc44a1Q6X893 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc44a1Q6X893 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc44a1Q6X893 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc44a1Q6X893 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc44a1Q6X893 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc44a1Q6X893 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc44a1Q6X893 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc44a1Q6X893 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc44a1Q6X893 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc44a1Q6X893 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc44a1Q6X893 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc44a1Q6X893 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc44a1Q6X893 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc44a1Q6X893 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc44a1Q6X893 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc44a1Q6X893 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc44a1Q6X893 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc44a1Q6X893 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc44a1Q6X893 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc44a1Q6X893 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc44a1Q6X893 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc44a1Q6X893 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc44a1Q6X893 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc44a1Q6X893 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc44a1Q6X893 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc44a1Q6X893 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc44a1Q6X893 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc44a1Q6X893 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc44a1Q6X893 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc44a1Q6X893 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc44a1Q6X893 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc44a1Q6X893 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc44a1Q6X893 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc44a1Q6X893 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc44a1Q6X893 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc44a1Q6X893 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc44a1Q6X893 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc44a1Q6X893 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc44a1Q6X893 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc44a1Q6X893 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc44a1Q6X893 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc44a1Q6X893 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc44a1Q6X893 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc44a1Q6X893 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc44a1Q6X893 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc44a1Q6X893 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc44a1Q6X893 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc44a1Q6X893 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc44a1Q6X893 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc44a1Q6X893 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc44a1Q6X893 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc44a1Q6X893 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc44a1Q6X893 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc44a1Q6X893 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc44a1Q6X893 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc44a1Q6X893 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc44a1Q6X893 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc44a1Q6X893 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc44a1Q6X893 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc44a1Q6X893 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms