Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptx4Q6RUU0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptx4Q6RUU0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptx4Q6RUU0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptx4Q6RUU0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptx4Q6RUU0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptx4Q6RUU0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptx4Q6RUU0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptx4Q6RUU0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptx4Q6RUU0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptx4Q6RUU0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ptx4Q6RUU0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ptx4Q6RUU0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ptx4Q6RUU0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ptx4Q6RUU0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ptx4Q6RUU0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptx4Q6RUU0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptx4Q6RUU0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptx4Q6RUU0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptx4Q6RUU0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptx4Q6RUU0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptx4Q6RUU0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptx4Q6RUU0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptx4Q6RUU0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptx4Q6RUU0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptx4Q6RUU0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptx4Q6RUU0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptx4Q6RUU0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptx4Q6RUU0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptx4Q6RUU0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptx4Q6RUU0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptx4Q6RUU0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptx4Q6RUU0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptx4Q6RUU0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptx4Q6RUU0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptx4Q6RUU0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptx4Q6RUU0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptx4Q6RUU0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptx4Q6RUU0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptx4Q6RUU0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ptx4Q6RUU0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms