Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIX5

Rhbdf1, Inactive rhomboid protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdf1Q6PIX5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rhbdf1Q6PIX5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rhbdf1Q6PIX5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rhbdf1Q6PIX5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rhbdf1Q6PIX5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rhbdf1Q6PIX5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rhbdf1Q6PIX5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rhbdf1Q6PIX5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rhbdf1Q6PIX5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhbdf1Q6PIX5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhbdf1Q6PIX5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhbdf1Q6PIX5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhbdf1Q6PIX5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhbdf1Q6PIX5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhbdf1Q6PIX5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhbdf1Q6PIX5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhbdf1Q6PIX5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhbdf1Q6PIX5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhbdf1Q6PIX5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhbdf1Q6PIX5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rhbdf1Q6PIX5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rhbdf1Q6PIX5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rhbdf1Q6PIX5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rhbdf1Q6PIX5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rhbdf1Q6PIX5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rhbdf1Q6PIX5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rhbdf1Q6PIX5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rhbdf1Q6PIX5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhbdf1Q6PIX5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhbdf1Q6PIX5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhbdf1Q6PIX5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhbdf1Q6PIX5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhbdf1Q6PIX5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhbdf1Q6PIX5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhbdf1Q6PIX5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhbdf1Q6PIX5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhbdf1Q6PIX5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhbdf1Q6PIX5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rhbdf1Q6PIX5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rhbdf1Q6PIX5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rhbdf1Q6PIX5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rhbdf1Q6PIX5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rhbdf1Q6PIX5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rhbdf1Q6PIX5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rhbdf1Q6PIX5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rhbdf1Q6PIX5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rhbdf1Q6PIX5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rhbdf1Q6PIX5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rhbdf1Q6PIX5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rhbdf1Q6PIX5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rhbdf1Q6PIX5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rhbdf1Q6PIX5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rhbdf1Q6PIX5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rhbdf1Q6PIX5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rhbdf1Q6PIX5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rhbdf1Q6PIX5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rhbdf1Q6PIX5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rhbdf1Q6PIX5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rhbdf1Q6PIX5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rhbdf1Q6PIX5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rhbdf1Q6PIX5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rhbdf1Q6PIX5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rhbdf1Q6PIX5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rhbdf1Q6PIX5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Rhbdf1Q6PIX5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhbdf1Q6PIX5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhbdf1Q6PIX5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhbdf1Q6PIX5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhbdf1Q6PIX5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhbdf1Q6PIX5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhbdf1Q6PIX5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhbdf1Q6PIX5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhbdf1Q6PIX5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhbdf1Q6PIX5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhbdf1Q6PIX5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhbdf1Q6PIX5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhbdf1Q6PIX5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhbdf1Q6PIX5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhbdf1Q6PIX5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhbdf1Q6PIX5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhbdf1Q6PIX5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhbdf1Q6PIX5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhbdf1Q6PIX5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhbdf1Q6PIX5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhbdf1Q6PIX5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhbdf1Q6PIX5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhbdf1Q6PIX5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhbdf1Q6PIX5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhbdf1Q6PIX5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhbdf1Q6PIX5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rhbdf1Q6PIX5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rhbdf1Q6PIX5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rhbdf1Q6PIX5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rhbdf1Q6PIX5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rhbdf1Q6PIX5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rhbdf1Q6PIX5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rhbdf1Q6PIX5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rhbdf1Q6PIX5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhbdf1Q6PIX5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhbdf1Q6PIX5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms