Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NfrkbQ6PIJ4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NfrkbQ6PIJ4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NfrkbQ6PIJ4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NfrkbQ6PIJ4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NfrkbQ6PIJ4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NfrkbQ6PIJ4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NfrkbQ6PIJ4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NfrkbQ6PIJ4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NfrkbQ6PIJ4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NfrkbQ6PIJ4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NfrkbQ6PIJ4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NfrkbQ6PIJ4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NfrkbQ6PIJ4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NfrkbQ6PIJ4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NfrkbQ6PIJ4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NfrkbQ6PIJ4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NfrkbQ6PIJ4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NfrkbQ6PIJ4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NfrkbQ6PIJ4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NfrkbQ6PIJ4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NfrkbQ6PIJ4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NfrkbQ6PIJ4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NfrkbQ6PIJ4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NfrkbQ6PIJ4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NfrkbQ6PIJ4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NfrkbQ6PIJ4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NfrkbQ6PIJ4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NfrkbQ6PIJ4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NfrkbQ6PIJ4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NfrkbQ6PIJ4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NfrkbQ6PIJ4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NfrkbQ6PIJ4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NfrkbQ6PIJ4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NfrkbQ6PIJ4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NfrkbQ6PIJ4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NfrkbQ6PIJ4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NfrkbQ6PIJ4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NfrkbQ6PIJ4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NfrkbQ6PIJ4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NfrkbQ6PIJ4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NfrkbQ6PIJ4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NfrkbQ6PIJ4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NfrkbQ6PIJ4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NfrkbQ6PIJ4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NfrkbQ6PIJ4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NfrkbQ6PIJ4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NfrkbQ6PIJ4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NfrkbQ6PIJ4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NfrkbQ6PIJ4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NfrkbQ6PIJ4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NfrkbQ6PIJ4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NfrkbQ6PIJ4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NfrkbQ6PIJ4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NfrkbQ6PIJ4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NfrkbQ6PIJ4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NfrkbQ6PIJ4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NfrkbQ6PIJ4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NfrkbQ6PIJ4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NfrkbQ6PIJ4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NfrkbQ6PIJ4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NfrkbQ6PIJ4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NfrkbQ6PIJ4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NfrkbQ6PIJ4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NfrkbQ6PIJ4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NfrkbQ6PIJ4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NfrkbQ6PIJ4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NfrkbQ6PIJ4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NfrkbQ6PIJ4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NfrkbQ6PIJ4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NfrkbQ6PIJ4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NfrkbQ6PIJ4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NfrkbQ6PIJ4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NfrkbQ6PIJ4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NfrkbQ6PIJ4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NfrkbQ6PIJ4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NfrkbQ6PIJ4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NfrkbQ6PIJ4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NfrkbQ6PIJ4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NfrkbQ6PIJ4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NfrkbQ6PIJ4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NfrkbQ6PIJ4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NfrkbQ6PIJ4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NfrkbQ6PIJ4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NfrkbQ6PIJ4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NfrkbQ6PIJ4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NfrkbQ6PIJ4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NfrkbQ6PIJ4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NfrkbQ6PIJ4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NfrkbQ6PIJ4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NfrkbQ6PIJ4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NfrkbQ6PIJ4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NfrkbQ6PIJ4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NfrkbQ6PIJ4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NfrkbQ6PIJ4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NfrkbQ6PIJ4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NfrkbQ6PIJ4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NfrkbQ6PIJ4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NfrkbQ6PIJ4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NfrkbQ6PIJ4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms