Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HjurpQ6PG16 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HjurpQ6PG16 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms